source: icGREP/icgrep-devel/icgrep/grep_engine.cpp @ 5364

Last change on this file since 5364 was 5364, checked in by cameron, 2 years ago

Consolidate pipeline compiler options in toolchain

File size: 29.4 KB
Line 
1/*
2 *  Copyright (c) 2016 International Characters.
3 *  This software is licensed to the public under the Open Software License 3.0.
4 *  icgrep is a trademark of International Characters.
5 */
6
7#include "grep_engine.h"
8#include <llvm/IR/Module.h>
9#include <llvm/ExecutionEngine/MCJIT.h>
10#include <llvm/IR/Verifier.h>
11#include <llvm/Support/CommandLine.h>
12#include <boost/filesystem.hpp>
13#include <boost/iostreams/device/mapped_file.hpp>
14#include <IR_Gen/idisa_builder.h>
15#include <IR_Gen/idisa_target.h>
16#include <UCD/UnicodeNameData.h>
17#include <UCD/resolve_properties.h>
18#include <kernels/cc_kernel.h>
19#include <kernels/linebreak_kernel.h>
20#include <kernels/streams_merge.h>
21#include <kernels/match_count.h>
22#include <kernels/mmap_kernel.h>
23#include <kernels/s2p_kernel.h>
24#include <kernels/scanmatchgen.h>
25#include <kernels/streamset.h>
26#include <kernels/interface.h>
27#include <pablo/pablo_compiler.h>
28#include <pablo/pablo_kernel.h>
29#include <pablo/pablo_toolchain.h>
30#include <re/re_cc.h>
31#include <re/re_toolchain.h>
32#include <toolchain.h>
33#include <iostream>
34#include <sstream>
35#ifdef CUDA_ENABLED
36#include <IR_Gen/CudaDriver.h>
37#include "preprocess.cpp"
38#endif
39#include <util/aligned_allocator.h>
40
41
42using namespace parabix;
43using namespace llvm;
44
45static cl::OptionCategory bGrepOutputOptions("Output Options",
46                                             "These options control the output.");
47static cl::opt<bool> SilenceFileErrors("s", cl::desc("Suppress messages for file errors."), cl::init(false),  cl::cat(bGrepOutputOptions));
48
49static cl::opt<bool> SuppressOutput("q", cl::desc("Suppress normal output; set return code only."), cl::init(false),  cl::cat(bGrepOutputOptions));
50
51static cl::opt<bool> NormalizeLineBreaks("normalize-line-breaks", cl::desc("Normalize line breaks to std::endl."), cl::init(false),  cl::cat(bGrepOutputOptions));
52
53static cl::opt<bool> ShowFileNames("H", cl::desc("Show the file name with each matching line."), cl::cat(bGrepOutputOptions));
54static cl::alias ShowFileNamesLong("with-filename", cl::desc("Alias for -H"), cl::aliasopt(ShowFileNames));
55
56static cl::opt<bool> ShowLineNumbers("n", cl::desc("Show the line number with each matching line."), cl::cat(bGrepOutputOptions));
57static cl::alias ShowLineNumbersLong("line-number", cl::desc("Alias for -n"), cl::aliasopt(ShowLineNumbers));
58
59bool isUTF_16 = false;
60std::string IRFilename = "icgrep.ll";
61std::string PTXFilename = "icgrep.ptx";
62
63static re::CC * parsedCodePointSet = nullptr;
64static std::vector<std::string> parsedPropertyValues;
65
66#ifdef CUDA_ENABLED
67int blockNo = 0;
68size_t * startPoints = nullptr;
69size_t * accumBytes = nullptr;
70#endif
71
72void GrepEngine::doGrep(const std::string & fileName, const int fileIdx, bool CountOnly, std::vector<size_t> & total_CountOnly, bool UTF_16) {
73    boost::filesystem::path file(fileName);
74    if (exists(file)) {
75        if (is_directory(file)) {
76            return;
77        }
78    } else {
79        if (!SilenceFileErrors) {
80            std::cerr << "Error: cannot open " << fileName << " for processing. Skipped.\n";
81            return;
82        }
83    }
84
85    const auto fileSize = file_size(file);
86    if (fileSize > 0) {
87        try {
88            boost::iostreams::mapped_file_source source(fileName, fileSize, 0);
89            char * fileBuffer = const_cast<char *>(source.data());
90           
91#ifdef CUDA_ENABLED 
92            if(codegen::NVPTX){
93                codegen::BlockSize = 128;
94                char * LineBreak;
95                if (posix_memalign((void**)&LineBreak, 32, fileSize)) {
96                    std::cerr << "Cannot allocate memory for linebreak.\n";
97                    exit(-1);
98                }
99                std::vector<size_t> LFPositions = preprocess(fileBuffer, fileSize, LineBreak);
100
101                const unsigned numOfGroups = codegen::GroupNum;
102                if (posix_memalign((void**)&startPoints, 8, (numOfGroups+1)*sizeof(size_t)) ||
103                    posix_memalign((void**)&accumBytes, 8, (numOfGroups+1)*sizeof(size_t))) {
104                    std::cerr << "Cannot allocate memory for startPoints or accumBytes.\n";
105                    exit(-1);
106                }
107
108                ulong * rslt = RunPTX(PTXFilename, fileBuffer, fileSize, CountOnly, LFPositions, startPoints, accumBytes);
109                if (CountOnly){
110                    exit(0);
111                }
112                else{
113                    size_t intputSize = startPoints[numOfGroups]-accumBytes[numOfGroups]+accumBytes[numOfGroups-1];
114                    mGrepFunction_CPU((char *)rslt, LineBreak, fileBuffer, intputSize, fileIdx);
115                    return;
116                }
117               
118            } 
119#endif
120            if (CountOnly) {
121                total_CountOnly[fileIdx] = mGrepFunction_CountOnly(fileBuffer, fileSize, fileIdx);
122            } else {
123                mGrepFunction(fileBuffer, fileSize, fileIdx);
124            }
125            source.close();
126        } catch (std::exception & e) {
127            if (!SilenceFileErrors) {
128                std::cerr << "Boost mmap error: " + fileName + ": " + e.what() + " Skipped.\n";
129                return;
130            }
131        }
132    } else {
133#ifdef CUDA_ENABLED
134        if (codegen::NVPTX){
135            std::cout << 0 << std::endl;
136            exit(0);
137        }
138#endif
139        if (CountOnly) {
140            total_CountOnly[fileIdx] = mGrepFunction_CountOnly(nullptr, 0, fileIdx);
141        } else {
142            mGrepFunction(nullptr, 0, fileIdx);
143        }
144    }
145}
146
147
148Function * generateGPUKernel(Module * m, IDISA::IDISA_Builder * iBuilder, bool CountOnly){
149    Type * const int64ty = iBuilder->getInt64Ty();
150    Type * const size_ty = iBuilder->getSizeTy();
151    Type * const int32ty = iBuilder->getInt32Ty();
152    Type * const sizeTyPtr = PointerType::get(size_ty, 1);
153    Type * const int64tyPtr = PointerType::get(int64ty, 1);
154    Type * const inputType = PointerType::get(iBuilder->getInt8Ty(), 1);
155    Type * const resultTy = iBuilder->getVoidTy();
156    Function * kernelFunc = cast<Function>(m->getOrInsertFunction("GPU_Main", resultTy, inputType, sizeTyPtr, sizeTyPtr, int64tyPtr, nullptr));
157    kernelFunc->setCallingConv(CallingConv::C);
158    Function::arg_iterator args = kernelFunc->arg_begin();
159
160    Value * const inputPtr = &*(args++);
161    inputPtr->setName("inputPtr");
162    Value * const startPointsPtr = &*(args++);
163    startPointsPtr->setName("startPointsPtr");
164    Value * const bufferSizesPtr = &*(args++);
165    bufferSizesPtr->setName("bufferSizesPtr");
166    Value * const outputPtr = &*(args++);
167    outputPtr->setName("resultPtr");
168
169    BasicBlock * entryBlock = BasicBlock::Create(m->getContext(), "entry", kernelFunc, 0);
170    iBuilder->SetInsertPoint(entryBlock);
171
172    Function * tidFunc = m->getFunction("llvm.nvvm.read.ptx.sreg.tid.x");
173    Value * tid = iBuilder->CreateCall(tidFunc);
174    Function * bidFunc = cast<Function>(m->getOrInsertFunction("llvm.nvvm.read.ptx.sreg.ctaid.x", int32ty, nullptr));
175    Value * bid = iBuilder->CreateCall(bidFunc);
176
177    Value * startPoint = iBuilder->CreateLoad(iBuilder->CreateGEP(startPointsPtr, bid));
178
179    Function * mainFunc = m->getFunction("Main");
180    Value * startBlock = iBuilder->CreateUDiv(startPoint, ConstantInt::get(int64ty, iBuilder->getBitBlockWidth()));
181    Type * const inputStreamType = PointerType::get(ArrayType::get(ArrayType::get(iBuilder->getBitBlockType(), 8), 1), 1);   
182    Value * inputStreamPtr = iBuilder->CreateGEP(iBuilder->CreateBitCast(inputPtr, inputStreamType), startBlock);
183    Value * inputStream = iBuilder->CreateGEP(inputStreamPtr, tid);
184    Value * bufferSize = iBuilder->CreateLoad(iBuilder->CreateGEP(bufferSizesPtr, bid));
185
186    if (CountOnly) {
187        Value * strideBlocks = ConstantInt::get(int32ty, iBuilder->getStride() / iBuilder->getBitBlockWidth());
188        Value * outputThreadPtr = iBuilder->CreateGEP(outputPtr, iBuilder->CreateAdd(iBuilder->CreateMul(bid, strideBlocks), tid));
189        Value * result = iBuilder->CreateCall(mainFunc, {inputStream, bufferSize});
190        iBuilder->CreateStore(result, outputThreadPtr);
191    } else {
192        Type * const outputStremType = PointerType::get(ArrayType::get(iBuilder->getBitBlockType(), 1), 1);
193        Value * outputStreamPtr = iBuilder->CreateGEP(iBuilder->CreateBitCast(outputPtr, outputStremType), startBlock);
194        Value * outputStream = iBuilder->CreateGEP(outputStreamPtr, tid);
195        iBuilder->CreateCall(mainFunc, {inputStream, bufferSize, outputStream});
196    }   
197
198    iBuilder->CreateRetVoid();
199    return kernelFunc;
200}
201
202Function * generateCPUKernel(Module * m, IDISA::IDISA_Builder * iBuilder, GrepType grepType){
203    Type * const size_ty = iBuilder->getSizeTy();
204    Type * const int8PtrTy = iBuilder->getInt8PtrTy();
205    Type * const rsltType = PointerType::get(ArrayType::get(iBuilder->getBitBlockType(), 1), 0);
206    Function * const mainCPUFn = cast<Function>(m->getOrInsertFunction("CPU_Main", iBuilder->getVoidTy(), rsltType, rsltType, int8PtrTy, size_ty, size_ty, nullptr));
207    mainCPUFn->setCallingConv(CallingConv::C);
208    iBuilder->SetInsertPoint(BasicBlock::Create(m->getContext(), "entry", mainCPUFn, 0));
209    Function::arg_iterator args = mainCPUFn->arg_begin();
210   
211    Value * const rsltStream = &*(args++);
212    rsltStream->setName("rslt");
213    Value * const lbStream = &*(args++);
214    lbStream->setName("lb");
215    Value * const inputStream = &*(args++);
216    inputStream->setName("input");
217    Value * const fileSize = &*(args++);
218    fileSize->setName("fileSize");
219    Value * const fileIdx = &*(args++);
220    fileIdx->setName("fileIdx");
221
222    const unsigned segmentSize = codegen::SegmentSize;
223   
224    ExternalFileBuffer MatchResults(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(1, 1));
225    MatchResults.setStreamSetBuffer(rsltStream, fileSize);
226
227    kernel::MMapSourceKernel mmapK1(iBuilder, segmentSize); 
228    mmapK1.setName("mmap1");
229    mmapK1.generateKernel({}, {&MatchResults});
230    mmapK1.setInitialArguments({fileSize});
231
232    ExternalFileBuffer LineBreak(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(1, 1));
233    LineBreak.setStreamSetBuffer(lbStream, fileSize);
234   
235    kernel::MMapSourceKernel mmapK2(iBuilder, segmentSize); 
236    mmapK2.setName("mmap2");
237    mmapK2.generateKernel({}, {&LineBreak});
238    mmapK2.setInitialArguments({fileSize});
239
240    kernel::ScanMatchKernel scanMatchK(iBuilder, grepType);
241    scanMatchK.generateKernel({&MatchResults, &LineBreak}, {});
242    scanMatchK.setInitialArguments({iBuilder->CreateBitCast(inputStream, int8PtrTy), fileSize, fileIdx});
243   
244    generatePipeline(iBuilder, {&mmapK1, &mmapK2, &scanMatchK});
245    iBuilder->CreateRetVoid();
246
247    return mainCPUFn;
248}
249
250void GrepEngine::multiGrepCodeGen(std::string moduleName, std::vector<re::RE *> REs, bool CountOnly, bool UTF_16, GrepType grepType) {
251
252    isUTF_16 = UTF_16;
253    Module * M = new Module(moduleName + ":icgrep", getGlobalContext());; 
254    IDISA::IDISA_Builder * iBuilder = IDISA::GetIDISA_Builder(M);; 
255
256    const unsigned segmentSize = codegen::SegmentSize;
257    const unsigned bufferSegments = codegen::BufferSegments * codegen::ThreadNum;
258    const unsigned encodingBits = UTF_16 ? 16 : 8;
259
260    mGrepType = grepType;
261
262    Type * const size_ty = iBuilder->getSizeTy();
263    Type * const int8PtrTy = iBuilder->getInt8PtrTy();
264    Type * const inputType = PointerType::get(ArrayType::get(ArrayType::get(iBuilder->getBitBlockType(), encodingBits), 1), 0);
265    Type * const resultTy = CountOnly ? size_ty : iBuilder->getVoidTy();
266
267    Function * mainFn = cast<Function>(M->getOrInsertFunction("Main", resultTy, inputType, size_ty, size_ty, nullptr));
268    mainFn->setCallingConv(CallingConv::C);
269    iBuilder->SetInsertPoint(BasicBlock::Create(M->getContext(), "entry", mainFn, 0));
270    Function::arg_iterator args = mainFn->arg_begin();
271   
272    Value * inputStream = &*(args++);
273    inputStream->setName("input");
274    Value * fileSize = &*(args++);
275    fileSize->setName("fileSize");
276    Value * fileIdx = &*(args++);
277    fileIdx->setName("fileIdx");
278
279    ExternalFileBuffer ByteStream(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(1, 8));   
280    CircularBuffer BasisBits(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(8), segmentSize * bufferSegments);
281    ByteStream.setStreamSetBuffer(inputStream, fileSize);
282    BasisBits.allocateBuffer();
283   
284    kernel::MMapSourceKernel mmapK(iBuilder, segmentSize); 
285    mmapK.generateKernel({}, {&ByteStream});
286    mmapK.setInitialArguments({fileSize});
287
288    kernel::S2PKernel  s2pk(iBuilder);
289    s2pk.generateKernel({&ByteStream}, {&BasisBits});
290   
291    std::vector<pablo::PabloKernel *> icgrepKs;
292    std::vector<StreamSetBuffer *> MatchResultsBufs;
293
294    for(unsigned i=0; i<REs.size(); i++){   
295        pablo::PabloKernel * icgrepK = new pablo::PabloKernel(iBuilder, "icgrep"+std::to_string(i), {Binding{iBuilder->getStreamSetTy(8), "basis"}, Binding{iBuilder->getStreamSetTy(1, 1), "linebreak"}});
296        re::re2pablo_compiler(icgrepK, re::regular_expression_passes(REs[i]), false);
297        pablo_function_passes(icgrepK);
298        icgrepKs.push_back(icgrepK);
299        CircularBuffer * MatchResults = new CircularBuffer(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(2, 1), segmentSize * bufferSegments);       
300        MatchResults->allocateBuffer();
301        MatchResultsBufs.push_back(MatchResults);
302    }   
303
304    std::vector<kernel::KernelBuilder *> KernelList;
305    KernelList.push_back(&mmapK);
306    KernelList.push_back(&s2pk);
307
308    CircularBuffer mergedResults(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments);
309    mergedResults.allocateBuffer();
310
311    kernel::StreamsMerge streamsMergeK(iBuilder, 1, REs.size());
312    streamsMergeK.generateKernel(MatchResultsBufs, {&mergedResults});
313
314    kernel::LineBreakKernelBuilder linebreakK(iBuilder, "lb", encodingBits);
315    CircularBuffer LineBreakStream(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments);
316    LineBreakStream.allocateBuffer();
317    linebreakK.generateKernel({&BasisBits}, {&LineBreakStream});
318   
319    KernelList.push_back(&linebreakK);
320    for(unsigned i=0; i<REs.size(); i++){
321        icgrepKs[i]->generateKernel({&BasisBits, &LineBreakStream}, {MatchResultsBufs[i]});
322        KernelList.push_back(icgrepKs[i]);
323    }
324    KernelList.push_back(&streamsMergeK);
325
326    if (CountOnly) {
327        kernel::MatchCount matchCountK(iBuilder);
328        matchCountK.generateKernel({&mergedResults}, {}); 
329
330        KernelList.push_back(&matchCountK); 
331
332        generatePipeline(iBuilder, KernelList);
333        iBuilder->CreateRet(matchCountK.getScalarField(matchCountK.getInstance(), "matchedLineCount"));
334
335    } else {
336        kernel::ScanMatchKernel scanMatchK(iBuilder, mGrepType);
337        scanMatchK.generateKernel({&mergedResults, &LineBreakStream}, {});               
338        scanMatchK.setInitialArguments({iBuilder->CreateBitCast(inputStream, int8PtrTy), fileSize, fileIdx});
339
340        KernelList.push_back(&scanMatchK);
341
342        generatePipeline(iBuilder, KernelList);
343       
344        iBuilder->CreateRetVoid();
345    }
346   
347    mEngine = JIT_to_ExecutionEngine(M);
348    ApplyObjectCache(mEngine);
349    icgrep_Linking(M, mEngine);
350
351#ifndef NDEBUG
352    verifyModule(*M, &dbgs());
353#endif
354
355    mEngine->finalizeObject();
356    delete iBuilder;
357   
358    if (CountOnly) {
359        mGrepFunction_CountOnly = reinterpret_cast<GrepFunctionType_CountOnly>(mEngine->getPointerToFunction(mainFn));
360    } else {
361        mGrepFunction = reinterpret_cast<GrepFunctionType>(mEngine->getPointerToFunction(mainFn));
362    }
363
364}
365
366void GrepEngine::grepCodeGen(std::string moduleName, re::RE * re_ast, bool CountOnly, bool UTF_16, GrepType grepType) {
367    isUTF_16 = UTF_16;
368    int addrSpace = 0;
369    bool CPU_Only = true;
370    Module * M = nullptr; 
371    IDISA::IDISA_Builder * iBuilder = nullptr; 
372
373#ifdef CUDA_ENABLED
374    setNVPTXOption(); 
375    if (codegen::NVPTX) {
376        Module * gpuM = new Module(moduleName+":gpu", getGlobalContext());
377        IDISA::IDISA_Builder * GPUBuilder = IDISA::GetIDISA_GPU_Builder(gpuM);
378        M = gpuM;
379        iBuilder = GPUBuilder;
380        M->setDataLayout("e-p:64:64:64-i1:8:8-i8:8:8-i16:16:16-i32:32:32-i64:64:64-f32:32:32-f64:64:64-v16:16:16-v32:32:32-v64:64:64-v128:128:128-n16:32:64");
381        M->setTargetTriple("nvptx64-nvidia-cuda");
382        addrSpace = 1;
383        CPU_Only = false;
384        codegen::BlockSize = 64;
385    }
386#endif
387
388    Module * cpuM = new Module(moduleName + ":cpu", getGlobalContext());
389    IDISA::IDISA_Builder * CPUBuilder = IDISA::GetIDISA_Builder(cpuM);
390
391    if (CPU_Only) {
392        M = cpuM;
393        iBuilder = CPUBuilder;
394    }
395
396    // segment size made availabe for each call to the mmap source kernel
397    const unsigned segmentSize = codegen::SegmentSize;
398    const unsigned bufferSegments = codegen::BufferSegments * codegen::ThreadNum;
399    const unsigned encodingBits = UTF_16 ? 16 : 8;
400
401    mGrepType = grepType;
402
403    Type * const size_ty = iBuilder->getSizeTy();
404    Type * const int8PtrTy = iBuilder->getInt8PtrTy();
405    Type * const inputType = PointerType::get(ArrayType::get(ArrayType::get(iBuilder->getBitBlockType(), encodingBits), 1), addrSpace);
406    Type * const resultTy = CountOnly ? size_ty : iBuilder->getVoidTy();
407
408    Function * mainFn = nullptr;
409    Value * inputStream = nullptr;
410    Value * fileSize = nullptr;
411    Value * fileIdx = nullptr;
412
413#ifdef CUDA_ENABLED   
414    Value * outputStream = nullptr;
415    Type * const outputType = PointerType::get(ArrayType::get(iBuilder->getBitBlockType(), 1), addrSpace);
416    if (codegen::NVPTX){
417        if (CountOnly){
418            mainFn = cast<Function>(M->getOrInsertFunction("Main", resultTy, inputType, size_ty, nullptr));
419            mainFn->setCallingConv(CallingConv::C);
420            iBuilder->SetInsertPoint(BasicBlock::Create(M->getContext(), "entry", mainFn, 0));
421            Function::arg_iterator args = mainFn->arg_begin();
422           
423            inputStream = &*(args++);
424            inputStream->setName("input");
425            fileSize = &*(args++);
426            fileSize->setName("fileSize");
427        } else {
428            mainFn = cast<Function>(M->getOrInsertFunction("Main", resultTy, inputType, size_ty, outputType, nullptr));
429            mainFn->setCallingConv(CallingConv::C);
430            iBuilder->SetInsertPoint(BasicBlock::Create(M->getContext(), "entry", mainFn, 0));
431            Function::arg_iterator args = mainFn->arg_begin();
432           
433            inputStream = &*(args++);
434            inputStream->setName("input");
435            fileSize = &*(args++);
436            fileSize->setName("fileSize");
437            outputStream = &*(args++);
438            outputStream->setName("output");
439        }
440    } 
441#endif
442    if (CPU_Only) {
443        mainFn = cast<Function>(M->getOrInsertFunction("Main", resultTy, inputType, size_ty, size_ty, nullptr));
444        mainFn->setCallingConv(CallingConv::C);
445        iBuilder->SetInsertPoint(BasicBlock::Create(M->getContext(), "entry", mainFn, 0));
446        Function::arg_iterator args = mainFn->arg_begin();
447       
448        inputStream = &*(args++);
449        inputStream->setName("input");
450        fileSize = &*(args++);
451        fileSize->setName("fileSize");
452        fileIdx = &*(args++);
453        fileIdx->setName("fileIdx");
454    }
455       
456    ExternalFileBuffer ByteStream(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(1, 8));
457   
458    kernel::MMapSourceKernel mmapK(iBuilder, segmentSize); 
459    mmapK.generateKernel({}, {&ByteStream});
460    mmapK.setInitialArguments({fileSize});
461   
462    CircularBuffer BasisBits(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(8), segmentSize * bufferSegments);
463
464    kernel::S2PKernel  s2pk(iBuilder);
465    s2pk.generateKernel({&ByteStream}, {&BasisBits});
466   
467    kernel::LineBreakKernelBuilder linebreakK(iBuilder, "lb", encodingBits);
468    CircularBuffer LineBreakStream(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments);
469
470    linebreakK.generateKernel({&BasisBits}, {&LineBreakStream});
471    LineBreakStream.allocateBuffer();
472
473    pablo::PabloKernel icgrepK(iBuilder, "icgrep", {Binding{iBuilder->getStreamSetTy(8), "basis"}, Binding{iBuilder->getStreamSetTy(1, 1), "linebreak"}});
474    re::re2pablo_compiler(&icgrepK, re::regular_expression_passes(re_ast), CountOnly);
475    pablo_function_passes(&icgrepK);
476
477    ByteStream.setStreamSetBuffer(inputStream, fileSize);
478    BasisBits.allocateBuffer();
479
480    if (CountOnly) {
481        icgrepK.generateKernel({&BasisBits, &LineBreakStream}, {});
482        generatePipeline(iBuilder, {&mmapK, &s2pk, &linebreakK, &icgrepK});
483        iBuilder->CreateRet(icgrepK.createGetAccumulatorCall(icgrepK.getInstance(), "matchedLineCount"));
484    } else {
485#ifdef CUDA_ENABLED
486        if (codegen::NVPTX){
487            ExternalFileBuffer MatchResults(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(1, 1), addrSpace);
488            MatchResults.setStreamSetBuffer(outputStream, fileSize);
489
490            icgrepK.generateKernel({&BasisBits, &LineBreakStream},  {&MatchResults});
491            generatePipelineLoop(iBuilder, {&mmapK, &s2pk, &linebreakK, &icgrepK});
492
493        }
494#endif
495        if (CPU_Only) {
496            CircularBuffer MatchResults(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments);
497            MatchResults.allocateBuffer();
498
499            icgrepK.generateKernel({&BasisBits, &LineBreakStream}, {&MatchResults});
500
501            kernel::ScanMatchKernel scanMatchK(iBuilder, mGrepType);
502            scanMatchK.generateKernel({&MatchResults, &LineBreakStream}, {});               
503            scanMatchK.setInitialArguments({iBuilder->CreateBitCast(inputStream, int8PtrTy), fileSize, fileIdx});
504           
505            generatePipeline(iBuilder, {&mmapK, &s2pk, &linebreakK, &icgrepK, &scanMatchK});
506        }
507        iBuilder->CreateRetVoid();
508    }
509
510#ifdef CUDA_ENABLED
511    Function * mainCPUFn = nullptr;
512    if(codegen::NVPTX){
513        Function * kernelFunction = generateGPUKernel(M, iBuilder, CountOnly);
514        MDNode * Node = MDNode::get(M->getContext(),
515                                    {llvm::ValueAsMetadata::get(kernelFunction),
516                                     MDString::get(M->getContext(), "kernel"), 
517                                     ConstantAsMetadata::get(ConstantInt::get(iBuilder->getInt32Ty(), 1))});
518        NamedMDNode *NMD = M->getOrInsertNamedMetadata("nvvm.annotations");
519        NMD->addOperand(Node);
520   
521        Compile2PTX(M, IRFilename, PTXFilename);
522        mainCPUFn = generateCPUKernel(cpuM, CPUBuilder, mGrepType);
523        if (CountOnly) return;
524    }
525#endif
526
527
528    mEngine = JIT_to_ExecutionEngine(cpuM);
529    ApplyObjectCache(mEngine);
530    icgrep_Linking(cpuM, mEngine);
531
532#ifndef NDEBUG
533    verifyModule(*M, &dbgs());
534#endif
535
536    mEngine->finalizeObject();
537    delete iBuilder;
538   
539    if (CountOnly) {
540        mGrepFunction_CountOnly = reinterpret_cast<GrepFunctionType_CountOnly>(mEngine->getPointerToFunction(mainFn));
541    } else {
542#ifdef CUDA_ENABLED
543        if(codegen::NVPTX){
544            mGrepFunction_CPU = reinterpret_cast<GrepFunctionType_CPU>(mEngine->getPointerToFunction(mainCPUFn));
545        }
546#endif
547        if (CPU_Only) {
548            mGrepFunction = reinterpret_cast<GrepFunctionType>(mEngine->getPointerToFunction(mainFn));
549        }
550    }
551
552}
553
554re::CC * GrepEngine::grepCodepoints() {
555    parsedCodePointSet = re::makeCC();
556    char * mFileBuffer = getUnicodeNameDataPtr();
557    size_t mFileSize = getUnicodeNameDataSize();
558    mGrepFunction(mFileBuffer, mFileSize, 0);
559    return parsedCodePointSet;
560}
561
562const std::vector<std::string> & GrepEngine::grepPropertyValues(const std::string& propertyName) {
563    enum { MaxSupportedVectorWidthInBytes = 32 };
564    AlignedAllocator<char, MaxSupportedVectorWidthInBytes> alloc;
565    parsedPropertyValues.clear();
566    const std::string & str = UCD::getPropertyValueGrepString(propertyName);
567    const auto n = str.length();
568    // NOTE: MaxSupportedVectorWidthInBytes of trailing 0s are needed to prevent the grep function from
569    // erroneously matching garbage data when loading the final partial block.
570    char * aligned = alloc.allocate(n + MaxSupportedVectorWidthInBytes, 0);
571    std::memcpy(aligned, str.data(), n);
572    std::memset(aligned + n, 0, MaxSupportedVectorWidthInBytes);
573    mGrepFunction(aligned, n, 0);
574    alloc.deallocate(aligned, 0);
575    return parsedPropertyValues;
576}
577
578static int * total_count;
579static std::stringstream * resultStrs = nullptr;
580static std::vector<std::string> inputFiles;
581
582void initResult(std::vector<std::string> filenames){
583    const int n = filenames.size();
584    if (n > 1) {
585        ShowFileNames = true;
586    }
587    inputFiles = filenames;
588    resultStrs = new std::stringstream[n];
589    total_count = new int[n];
590    for (unsigned i = 0; i < inputFiles.size(); ++i){
591        total_count[i] = 0;
592    }
593   
594}
595
596extern "C" {
597    void wrapped_report_match(size_t lineNum, size_t line_start, size_t line_end, const char * buffer, size_t filesize, int fileIdx) {
598        assert (buffer);
599#ifdef CUDA_ENABLED
600    if (codegen::NVPTX){
601        while(line_start>startPoints[blockNo]) blockNo++;
602        line_start -= accumBytes[blockNo-1];
603        line_end -= accumBytes[blockNo-1];
604    }
605#endif
606        int index = isUTF_16 ? 2 : 1;
607        int idx = fileIdx;
608         
609        if (ShowFileNames) {
610            resultStrs[idx] << inputFiles[idx] << ':';
611        }
612        if (ShowLineNumbers) {
613            resultStrs[idx] << lineNum << ":";
614        }
615       
616        if ((!isUTF_16 && buffer[line_start] == 0xA) && (line_start != line_end)) {
617            // The line "starts" on the LF of a CRLF.  Really the end of the last line.
618            line_start++;
619        }
620        if (((isUTF_16 && buffer[line_start] == 0x0) && buffer[line_start + 1] == 0xA) && (line_start != line_end)) {
621            // The line "starts" on the LF of a CRLF.  Really the end of the last line.
622            line_start += 2;
623        }
624        if (line_end == filesize) {
625            // The match position is at end-of-file.   We have a final unterminated line.
626            resultStrs[idx].write(&buffer[line_start * index], (line_end - line_start) * index);
627            if (NormalizeLineBreaks) {
628                resultStrs[idx] << '\n';  // terminate it
629            }
630            return;
631        }
632        unsigned char end_byte = (unsigned char)buffer[line_end]; 
633        unsigned char penult_byte = (unsigned char)(buffer[line_end - 1]);
634        if (NormalizeLineBreaks) {
635            if (end_byte == 0x85) {
636                // Line terminated with NEL, on the second byte.  Back up 1.
637                line_end--;
638            } else if (end_byte > 0xD) {
639                // Line terminated with PS or LS, on the third byte.  Back up 2.
640                isUTF_16 ? line_end-- : line_end -= 2;
641            }
642            resultStrs[idx].write(&buffer[line_start * index], (line_end - line_start) * index);
643            resultStrs[idx] << '\n';
644        } else {
645            if ((!isUTF_16 && end_byte == 0x0D) || (isUTF_16 && (end_byte == 0x0D && penult_byte == 0x0))) {
646                // Check for line_end on first byte of CRLF;  note that we don't
647                // want to access past the end of buffer.
648                if (line_end + 1 < filesize) {
649                    if (!isUTF_16 && buffer[line_end + 1] == 0x0A) {
650                        // Found CRLF; preserve both bytes.
651                        line_end++;
652                    }
653                    if (isUTF_16 && buffer[line_end + 1] == 0x0 && buffer[line_end + 2] == 0x0A) {
654                        // Found CRLF; preserve both bytes.
655                        line_end += 2;
656                    }
657                }
658            }
659            resultStrs[idx].write(&buffer[line_start * index], (line_end - line_start + 1) * index);
660        }
661    }
662}
663
664void PrintResult(bool CountOnly, std::vector<size_t> & total_CountOnly){
665   
666    if(CountOnly){
667        if (!ShowFileNames) {
668            for (unsigned i = 0; i < inputFiles.size(); ++i){
669                std::cout << total_CountOnly[i] << std::endl;
670            }
671        }
672        else {
673            for (unsigned i = 0; i < inputFiles.size(); ++i){
674                std::cout << inputFiles[i] << ':' << total_CountOnly[i] << std::endl;
675            };
676        }
677        return;
678    }
679   
680    for (unsigned i = 0; i < inputFiles.size(); ++i){
681        std::cout << resultStrs[i].str();
682    }
683}
684
685extern "C" {
686    void insert_codepoints(size_t lineNum, size_t line_start, size_t line_end, const char * buffer) {
687        assert (buffer);
688        re::codepoint_t c = 0;
689        ssize_t line_pos = line_start;
690        while (isxdigit(buffer[line_pos])) {
691            if (isdigit(buffer[line_pos])) {
692                c = (c << 4) | (buffer[line_pos] - '0');
693            }
694            else {
695                c = (c << 4) | (tolower(buffer[line_pos]) - 'a' + 10);
696            }
697            line_pos++;
698        }
699        assert(((line_pos - line_start) >= 4) && ((line_pos - line_start) <= 6)); // UCD format 4 to 6 hex digits.       
700        parsedCodePointSet->insert(c);
701    }
702}
703
704extern "C" {
705    void insert_property_values(size_t lineNum, size_t line_start, size_t line_end, const char * buffer) {
706        parsedPropertyValues.emplace_back(buffer + line_start, buffer + line_end);
707    }
708}
709
710void icgrep_Linking(Module * m, ExecutionEngine * e) {
711    Module::FunctionListType & fns = m->getFunctionList();
712    for (auto it = fns.begin(), it_end = fns.end(); it != it_end; ++it) {
713        std::string fnName = it->getName().str();
714        if (fnName == "s2p_block") continue;
715        if (fnName == "process_block") continue;
716        if (fnName == "process_block_initialize_carries") continue;
717       
718        if (fnName == "wrapped_report_match") {
719            e->addGlobalMapping(cast<GlobalValue>(it), (void *)&wrapped_report_match);
720        }
721        if (fnName == "insert_codepoints") {
722            e->addGlobalMapping(cast<GlobalValue>(it), (void *)&insert_codepoints);
723        }
724        if (fnName == "insert_property_values") {
725            e->addGlobalMapping(cast<GlobalValue>(it), (void *)&insert_property_values);
726        }
727    }
728}
729
730GrepEngine::GrepEngine()
731: mGrepFunction(nullptr)
732, mGrepFunction_CountOnly(nullptr)
733, mGrepFunction_CPU(nullptr)
734, mGrepType(GrepType::Normal)
735, mEngine(nullptr) {
736
737}
738
739GrepEngine::~GrepEngine() {
740    delete mEngine;
741}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.