source: icGREP/icgrep-devel/icgrep/grep_engine.cpp @ 5369

Last change on this file since 5369 was 5369, checked in by cameron, 2 years ago

CC multiplexing

File size: 29.5 KB
Line 
1/*
2 *  Copyright (c) 2016 International Characters.
3 *  This software is licensed to the public under the Open Software License 3.0.
4 *  icgrep is a trademark of International Characters.
5 */
6
7#include "grep_engine.h"
8#include <llvm/IR/Module.h>
9#include <llvm/ExecutionEngine/MCJIT.h>
10#include <llvm/IR/Verifier.h>
11#include <llvm/Support/CommandLine.h>
12#include <boost/filesystem.hpp>
13#include <boost/iostreams/device/mapped_file.hpp>
14#include <IR_Gen/idisa_builder.h>
15#include <IR_Gen/idisa_target.h>
16#include <UCD/UnicodeNameData.h>
17#include <UCD/resolve_properties.h>
18#include <kernels/cc_kernel.h>
19#include <kernels/linebreak_kernel.h>
20#include <kernels/streams_merge.h>
21#include <kernels/match_count.h>
22#include <kernels/mmap_kernel.h>
23#include <kernels/s2p_kernel.h>
24#include <kernels/scanmatchgen.h>
25#include <kernels/streamset.h>
26#include <kernels/interface.h>
27#include <pablo/pablo_compiler.h>
28#include <pablo/pablo_kernel.h>
29#include <pablo/pablo_toolchain.h>
30#include <re/re_cc.h>
31#include <re/re_toolchain.h>
32#include <toolchain.h>
33#include <iostream>
34#include <sstream>
35#include <cc/multiplex_CCs.h>
36#ifdef CUDA_ENABLED
37#include <IR_Gen/CudaDriver.h>
38#include "preprocess.cpp"
39#endif
40#include <util/aligned_allocator.h>
41
42
43using namespace parabix;
44using namespace llvm;
45
46static cl::OptionCategory bGrepOutputOptions("Output Options",
47                                             "These options control the output.");
48static cl::opt<bool> SilenceFileErrors("s", cl::desc("Suppress messages for file errors."), cl::init(false),  cl::cat(bGrepOutputOptions));
49
50static cl::opt<bool> SuppressOutput("q", cl::desc("Suppress normal output; set return code only."), cl::init(false),  cl::cat(bGrepOutputOptions));
51
52static cl::opt<bool> NormalizeLineBreaks("normalize-line-breaks", cl::desc("Normalize line breaks to std::endl."), cl::init(false),  cl::cat(bGrepOutputOptions));
53
54static cl::opt<bool> ShowFileNames("H", cl::desc("Show the file name with each matching line."), cl::cat(bGrepOutputOptions));
55static cl::alias ShowFileNamesLong("with-filename", cl::desc("Alias for -H"), cl::aliasopt(ShowFileNames));
56
57static cl::opt<bool> ShowLineNumbers("n", cl::desc("Show the line number with each matching line."), cl::cat(bGrepOutputOptions));
58static cl::alias ShowLineNumbersLong("line-number", cl::desc("Alias for -n"), cl::aliasopt(ShowLineNumbers));
59
60bool isUTF_16 = false;
61std::string IRFilename = "icgrep.ll";
62std::string PTXFilename = "icgrep.ptx";
63
64static re::CC * parsedCodePointSet = nullptr;
65static std::vector<std::string> parsedPropertyValues;
66
67#ifdef CUDA_ENABLED
68int blockNo = 0;
69size_t * startPoints = nullptr;
70size_t * accumBytes = nullptr;
71#endif
72
73void GrepEngine::doGrep(const std::string & fileName, const int fileIdx, bool CountOnly, std::vector<size_t> & total_CountOnly, bool UTF_16) {
74    boost::filesystem::path file(fileName);
75    if (exists(file)) {
76        if (is_directory(file)) {
77            return;
78        }
79    } else {
80        if (!SilenceFileErrors) {
81            std::cerr << "Error: cannot open " << fileName << " for processing. Skipped.\n";
82            return;
83        }
84    }
85
86    const auto fileSize = file_size(file);
87    if (fileSize > 0) {
88        try {
89            boost::iostreams::mapped_file_source source(fileName, fileSize, 0);
90            char * fileBuffer = const_cast<char *>(source.data());
91           
92#ifdef CUDA_ENABLED 
93            if(codegen::NVPTX){
94                codegen::BlockSize = 128;
95                char * LineBreak;
96                if (posix_memalign((void**)&LineBreak, 32, fileSize)) {
97                    std::cerr << "Cannot allocate memory for linebreak.\n";
98                    exit(-1);
99                }
100                std::vector<size_t> LFPositions = preprocess(fileBuffer, fileSize, LineBreak);
101
102                const unsigned numOfGroups = codegen::GroupNum;
103                if (posix_memalign((void**)&startPoints, 8, (numOfGroups+1)*sizeof(size_t)) ||
104                    posix_memalign((void**)&accumBytes, 8, (numOfGroups+1)*sizeof(size_t))) {
105                    std::cerr << "Cannot allocate memory for startPoints or accumBytes.\n";
106                    exit(-1);
107                }
108
109                ulong * rslt = RunPTX(PTXFilename, fileBuffer, fileSize, CountOnly, LFPositions, startPoints, accumBytes);
110                if (CountOnly){
111                    exit(0);
112                }
113                else{
114                    size_t intputSize = startPoints[numOfGroups]-accumBytes[numOfGroups]+accumBytes[numOfGroups-1];
115                    mGrepFunction_CPU((char *)rslt, LineBreak, fileBuffer, intputSize, fileIdx);
116                    return;
117                }
118               
119            } 
120#endif
121            if (CountOnly) {
122                total_CountOnly[fileIdx] = mGrepFunction_CountOnly(fileBuffer, fileSize, fileIdx);
123            } else {
124                mGrepFunction(fileBuffer, fileSize, fileIdx);
125            }
126            source.close();
127        } catch (std::exception & e) {
128            if (!SilenceFileErrors) {
129                std::cerr << "Boost mmap error: " + fileName + ": " + e.what() + " Skipped.\n";
130                return;
131            }
132        }
133    } else {
134#ifdef CUDA_ENABLED
135        if (codegen::NVPTX){
136            std::cout << 0 << std::endl;
137            exit(0);
138        }
139#endif
140        if (CountOnly) {
141            total_CountOnly[fileIdx] = mGrepFunction_CountOnly(nullptr, 0, fileIdx);
142        } else {
143            mGrepFunction(nullptr, 0, fileIdx);
144        }
145    }
146}
147
148
149Function * generateGPUKernel(Module * m, IDISA::IDISA_Builder * iBuilder, bool CountOnly){
150    Type * const int64ty = iBuilder->getInt64Ty();
151    Type * const size_ty = iBuilder->getSizeTy();
152    Type * const int32ty = iBuilder->getInt32Ty();
153    Type * const sizeTyPtr = PointerType::get(size_ty, 1);
154    Type * const int64tyPtr = PointerType::get(int64ty, 1);
155    Type * const inputType = PointerType::get(iBuilder->getInt8Ty(), 1);
156    Type * const resultTy = iBuilder->getVoidTy();
157    Function * kernelFunc = cast<Function>(m->getOrInsertFunction("GPU_Main", resultTy, inputType, sizeTyPtr, sizeTyPtr, int64tyPtr, nullptr));
158    kernelFunc->setCallingConv(CallingConv::C);
159    Function::arg_iterator args = kernelFunc->arg_begin();
160
161    Value * const inputPtr = &*(args++);
162    inputPtr->setName("inputPtr");
163    Value * const startPointsPtr = &*(args++);
164    startPointsPtr->setName("startPointsPtr");
165    Value * const bufferSizesPtr = &*(args++);
166    bufferSizesPtr->setName("bufferSizesPtr");
167    Value * const outputPtr = &*(args++);
168    outputPtr->setName("resultPtr");
169
170    BasicBlock * entryBlock = BasicBlock::Create(m->getContext(), "entry", kernelFunc, 0);
171    iBuilder->SetInsertPoint(entryBlock);
172
173    Function * tidFunc = m->getFunction("llvm.nvvm.read.ptx.sreg.tid.x");
174    Value * tid = iBuilder->CreateCall(tidFunc);
175    Function * bidFunc = cast<Function>(m->getOrInsertFunction("llvm.nvvm.read.ptx.sreg.ctaid.x", int32ty, nullptr));
176    Value * bid = iBuilder->CreateCall(bidFunc);
177
178    Value * startPoint = iBuilder->CreateLoad(iBuilder->CreateGEP(startPointsPtr, bid));
179
180    Function * mainFunc = m->getFunction("Main");
181    Value * startBlock = iBuilder->CreateUDiv(startPoint, ConstantInt::get(int64ty, iBuilder->getBitBlockWidth()));
182    Type * const inputStreamType = PointerType::get(ArrayType::get(ArrayType::get(iBuilder->getBitBlockType(), 8), 1), 1);   
183    Value * inputStreamPtr = iBuilder->CreateGEP(iBuilder->CreateBitCast(inputPtr, inputStreamType), startBlock);
184    Value * inputStream = iBuilder->CreateGEP(inputStreamPtr, tid);
185    Value * bufferSize = iBuilder->CreateLoad(iBuilder->CreateGEP(bufferSizesPtr, bid));
186
187    if (CountOnly) {
188        Value * strideBlocks = ConstantInt::get(int32ty, iBuilder->getStride() / iBuilder->getBitBlockWidth());
189        Value * outputThreadPtr = iBuilder->CreateGEP(outputPtr, iBuilder->CreateAdd(iBuilder->CreateMul(bid, strideBlocks), tid));
190        Value * result = iBuilder->CreateCall(mainFunc, {inputStream, bufferSize});
191        iBuilder->CreateStore(result, outputThreadPtr);
192    } else {
193        Type * const outputStremType = PointerType::get(ArrayType::get(iBuilder->getBitBlockType(), 1), 1);
194        Value * outputStreamPtr = iBuilder->CreateGEP(iBuilder->CreateBitCast(outputPtr, outputStremType), startBlock);
195        Value * outputStream = iBuilder->CreateGEP(outputStreamPtr, tid);
196        iBuilder->CreateCall(mainFunc, {inputStream, bufferSize, outputStream});
197    }   
198
199    iBuilder->CreateRetVoid();
200    return kernelFunc;
201}
202
203Function * generateCPUKernel(Module * m, IDISA::IDISA_Builder * iBuilder, GrepType grepType){
204    Type * const size_ty = iBuilder->getSizeTy();
205    Type * const int8PtrTy = iBuilder->getInt8PtrTy();
206    Type * const rsltType = PointerType::get(ArrayType::get(iBuilder->getBitBlockType(), 1), 0);
207    Function * const mainCPUFn = cast<Function>(m->getOrInsertFunction("CPU_Main", iBuilder->getVoidTy(), rsltType, rsltType, int8PtrTy, size_ty, size_ty, nullptr));
208    mainCPUFn->setCallingConv(CallingConv::C);
209    iBuilder->SetInsertPoint(BasicBlock::Create(m->getContext(), "entry", mainCPUFn, 0));
210    Function::arg_iterator args = mainCPUFn->arg_begin();
211   
212    Value * const rsltStream = &*(args++);
213    rsltStream->setName("rslt");
214    Value * const lbStream = &*(args++);
215    lbStream->setName("lb");
216    Value * const inputStream = &*(args++);
217    inputStream->setName("input");
218    Value * const fileSize = &*(args++);
219    fileSize->setName("fileSize");
220    Value * const fileIdx = &*(args++);
221    fileIdx->setName("fileIdx");
222
223    const unsigned segmentSize = codegen::SegmentSize;
224   
225    ExternalFileBuffer MatchResults(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(1, 1));
226    MatchResults.setStreamSetBuffer(rsltStream, fileSize);
227
228    kernel::MMapSourceKernel mmapK1(iBuilder, segmentSize); 
229    mmapK1.setName("mmap1");
230    mmapK1.generateKernel({}, {&MatchResults});
231    mmapK1.setInitialArguments({fileSize});
232
233    ExternalFileBuffer LineBreak(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(1, 1));
234    LineBreak.setStreamSetBuffer(lbStream, fileSize);
235   
236    kernel::MMapSourceKernel mmapK2(iBuilder, segmentSize); 
237    mmapK2.setName("mmap2");
238    mmapK2.generateKernel({}, {&LineBreak});
239    mmapK2.setInitialArguments({fileSize});
240
241    kernel::ScanMatchKernel scanMatchK(iBuilder, grepType);
242    scanMatchK.generateKernel({&MatchResults, &LineBreak}, {});
243    scanMatchK.setInitialArguments({iBuilder->CreateBitCast(inputStream, int8PtrTy), fileSize, fileIdx});
244   
245    generatePipeline(iBuilder, {&mmapK1, &mmapK2, &scanMatchK});
246    iBuilder->CreateRetVoid();
247
248    return mainCPUFn;
249}
250
251void GrepEngine::multiGrepCodeGen(std::string moduleName, std::vector<re::RE *> REs, bool CountOnly, bool UTF_16, GrepType grepType) {
252
253    isUTF_16 = UTF_16;
254    Module * M = new Module(moduleName + ":icgrep", getGlobalContext());; 
255    IDISA::IDISA_Builder * iBuilder = IDISA::GetIDISA_Builder(M);; 
256
257    const unsigned segmentSize = codegen::SegmentSize;
258    const unsigned bufferSegments = codegen::BufferSegments * codegen::ThreadNum;
259    const unsigned encodingBits = UTF_16 ? 16 : 8;
260
261    mGrepType = grepType;
262
263    Type * const size_ty = iBuilder->getSizeTy();
264    Type * const int8PtrTy = iBuilder->getInt8PtrTy();
265    Type * const inputType = PointerType::get(ArrayType::get(ArrayType::get(iBuilder->getBitBlockType(), encodingBits), 1), 0);
266    Type * const resultTy = CountOnly ? size_ty : iBuilder->getVoidTy();
267
268    Function * mainFn = cast<Function>(M->getOrInsertFunction("Main", resultTy, inputType, size_ty, size_ty, nullptr));
269    mainFn->setCallingConv(CallingConv::C);
270    iBuilder->SetInsertPoint(BasicBlock::Create(M->getContext(), "entry", mainFn, 0));
271    Function::arg_iterator args = mainFn->arg_begin();
272   
273    Value * inputStream = &*(args++);
274    inputStream->setName("input");
275    Value * fileSize = &*(args++);
276    fileSize->setName("fileSize");
277    Value * fileIdx = &*(args++);
278    fileIdx->setName("fileIdx");
279
280    ExternalFileBuffer ByteStream(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(1, 8));   
281    CircularBuffer BasisBits(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(8), segmentSize * bufferSegments);
282    ByteStream.setStreamSetBuffer(inputStream, fileSize);
283    BasisBits.allocateBuffer();
284   
285    kernel::MMapSourceKernel mmapK(iBuilder, segmentSize); 
286    mmapK.generateKernel({}, {&ByteStream});
287    mmapK.setInitialArguments({fileSize});
288
289    kernel::S2PKernel  s2pk(iBuilder);
290    s2pk.generateKernel({&ByteStream}, {&BasisBits});
291   
292    std::vector<pablo::PabloKernel *> icgrepKs;
293    std::vector<StreamSetBuffer *> MatchResultsBufs;
294
295    for(unsigned i=0; i<REs.size(); i++){   
296        pablo::PabloKernel * icgrepK = new pablo::PabloKernel(iBuilder, "icgrep"+std::to_string(i), {Binding{iBuilder->getStreamSetTy(8), "basis"}, Binding{iBuilder->getStreamSetTy(1, 1), "linebreak"}});
297        re::re2pablo_compiler(icgrepK, re::regular_expression_passes(REs[i]), false);
298        pablo_function_passes(icgrepK);
299        icgrepKs.push_back(icgrepK);
300        CircularBuffer * MatchResults = new CircularBuffer(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(2, 1), segmentSize * bufferSegments);       
301        MatchResults->allocateBuffer();
302        MatchResultsBufs.push_back(MatchResults);
303    }   
304
305    std::vector<kernel::KernelBuilder *> KernelList;
306    KernelList.push_back(&mmapK);
307    KernelList.push_back(&s2pk);
308
309    CircularBuffer mergedResults(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments);
310    mergedResults.allocateBuffer();
311
312    kernel::StreamsMerge streamsMergeK(iBuilder, 1, REs.size());
313    streamsMergeK.generateKernel(MatchResultsBufs, {&mergedResults});
314
315    kernel::LineBreakKernelBuilder linebreakK(iBuilder, "lb", encodingBits);
316    CircularBuffer LineBreakStream(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments);
317    LineBreakStream.allocateBuffer();
318    linebreakK.generateKernel({&BasisBits}, {&LineBreakStream});
319   
320    KernelList.push_back(&linebreakK);
321    for(unsigned i=0; i<REs.size(); i++){
322        icgrepKs[i]->generateKernel({&BasisBits, &LineBreakStream}, {MatchResultsBufs[i]});
323        KernelList.push_back(icgrepKs[i]);
324    }
325    KernelList.push_back(&streamsMergeK);
326
327    if (CountOnly) {
328        kernel::MatchCount matchCountK(iBuilder);
329        matchCountK.generateKernel({&mergedResults}, {}); 
330
331        KernelList.push_back(&matchCountK); 
332
333        generatePipeline(iBuilder, KernelList);
334        iBuilder->CreateRet(matchCountK.getScalarField(matchCountK.getInstance(), "matchedLineCount"));
335
336    } else {
337        kernel::ScanMatchKernel scanMatchK(iBuilder, mGrepType);
338        scanMatchK.generateKernel({&mergedResults, &LineBreakStream}, {});               
339        scanMatchK.setInitialArguments({iBuilder->CreateBitCast(inputStream, int8PtrTy), fileSize, fileIdx});
340
341        KernelList.push_back(&scanMatchK);
342
343        generatePipeline(iBuilder, KernelList);
344       
345        iBuilder->CreateRetVoid();
346    }
347   
348    mEngine = JIT_to_ExecutionEngine(M);
349    ApplyObjectCache(mEngine);
350    icgrep_Linking(M, mEngine);
351
352#ifndef NDEBUG
353    verifyModule(*M, &dbgs());
354#endif
355
356    mEngine->finalizeObject();
357    delete iBuilder;
358   
359    if (CountOnly) {
360        mGrepFunction_CountOnly = reinterpret_cast<GrepFunctionType_CountOnly>(mEngine->getPointerToFunction(mainFn));
361    } else {
362        mGrepFunction = reinterpret_cast<GrepFunctionType>(mEngine->getPointerToFunction(mainFn));
363    }
364
365}
366
367void GrepEngine::grepCodeGen(std::string moduleName, re::RE * re_ast, bool CountOnly, bool UTF_16, GrepType grepType) {
368    isUTF_16 = UTF_16;
369    int addrSpace = 0;
370    bool CPU_Only = true;
371    Module * M = nullptr; 
372    IDISA::IDISA_Builder * iBuilder = nullptr; 
373
374#ifdef CUDA_ENABLED
375    setNVPTXOption(); 
376    if (codegen::NVPTX) {
377        Module * gpuM = new Module(moduleName+":gpu", getGlobalContext());
378        IDISA::IDISA_Builder * GPUBuilder = IDISA::GetIDISA_GPU_Builder(gpuM);
379        M = gpuM;
380        iBuilder = GPUBuilder;
381        M->setDataLayout("e-p:64:64:64-i1:8:8-i8:8:8-i16:16:16-i32:32:32-i64:64:64-f32:32:32-f64:64:64-v16:16:16-v32:32:32-v64:64:64-v128:128:128-n16:32:64");
382        M->setTargetTriple("nvptx64-nvidia-cuda");
383        addrSpace = 1;
384        CPU_Only = false;
385        codegen::BlockSize = 64;
386    }
387#endif
388
389    Module * cpuM = new Module(moduleName + ":cpu", getGlobalContext());
390    IDISA::IDISA_Builder * CPUBuilder = IDISA::GetIDISA_Builder(cpuM);
391
392    if (CPU_Only) {
393        M = cpuM;
394        iBuilder = CPUBuilder;
395    }
396
397    // segment size made availabe for each call to the mmap source kernel
398    const unsigned segmentSize = codegen::SegmentSize;
399    const unsigned bufferSegments = codegen::BufferSegments * codegen::ThreadNum;
400    const unsigned encodingBits = UTF_16 ? 16 : 8;
401
402    mGrepType = grepType;
403
404    Type * const size_ty = iBuilder->getSizeTy();
405    Type * const int8PtrTy = iBuilder->getInt8PtrTy();
406    Type * const inputType = PointerType::get(ArrayType::get(ArrayType::get(iBuilder->getBitBlockType(), encodingBits), 1), addrSpace);
407    Type * const resultTy = CountOnly ? size_ty : iBuilder->getVoidTy();
408
409    Function * mainFn = nullptr;
410    Value * inputStream = nullptr;
411    Value * fileSize = nullptr;
412    Value * fileIdx = nullptr;
413
414#ifdef CUDA_ENABLED   
415    Value * outputStream = nullptr;
416    Type * const outputType = PointerType::get(ArrayType::get(iBuilder->getBitBlockType(), 1), addrSpace);
417    if (codegen::NVPTX){
418        if (CountOnly){
419            mainFn = cast<Function>(M->getOrInsertFunction("Main", resultTy, inputType, size_ty, nullptr));
420            mainFn->setCallingConv(CallingConv::C);
421            iBuilder->SetInsertPoint(BasicBlock::Create(M->getContext(), "entry", mainFn, 0));
422            Function::arg_iterator args = mainFn->arg_begin();
423           
424            inputStream = &*(args++);
425            inputStream->setName("input");
426            fileSize = &*(args++);
427            fileSize->setName("fileSize");
428        } else {
429            mainFn = cast<Function>(M->getOrInsertFunction("Main", resultTy, inputType, size_ty, outputType, nullptr));
430            mainFn->setCallingConv(CallingConv::C);
431            iBuilder->SetInsertPoint(BasicBlock::Create(M->getContext(), "entry", mainFn, 0));
432            Function::arg_iterator args = mainFn->arg_begin();
433           
434            inputStream = &*(args++);
435            inputStream->setName("input");
436            fileSize = &*(args++);
437            fileSize->setName("fileSize");
438            outputStream = &*(args++);
439            outputStream->setName("output");
440        }
441    } 
442#endif
443    if (CPU_Only) {
444        mainFn = cast<Function>(M->getOrInsertFunction("Main", resultTy, inputType, size_ty, size_ty, nullptr));
445        mainFn->setCallingConv(CallingConv::C);
446        iBuilder->SetInsertPoint(BasicBlock::Create(M->getContext(), "entry", mainFn, 0));
447        Function::arg_iterator args = mainFn->arg_begin();
448       
449        inputStream = &*(args++);
450        inputStream->setName("input");
451        fileSize = &*(args++);
452        fileSize->setName("fileSize");
453        fileIdx = &*(args++);
454        fileIdx->setName("fileIdx");
455    }
456       
457    ExternalFileBuffer ByteStream(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(1, 8));
458   
459    kernel::MMapSourceKernel mmapK(iBuilder, segmentSize); 
460    mmapK.generateKernel({}, {&ByteStream});
461    mmapK.setInitialArguments({fileSize});
462   
463    CircularBuffer BasisBits(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(8), segmentSize * bufferSegments);
464
465    kernel::S2PKernel  s2pk(iBuilder);
466    s2pk.generateKernel({&ByteStream}, {&BasisBits});
467   
468    kernel::LineBreakKernelBuilder linebreakK(iBuilder, "lb", encodingBits);
469    CircularBuffer LineBreakStream(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments);
470
471    linebreakK.generateKernel({&BasisBits}, {&LineBreakStream});
472    LineBreakStream.allocateBuffer();
473
474    pablo::PabloKernel icgrepK(iBuilder, "icgrep", {Binding{iBuilder->getStreamSetTy(8), "basis"}, Binding{iBuilder->getStreamSetTy(1, 1), "linebreak"}});
475    re::re2pablo_compiler(&icgrepK, re::regular_expression_passes(re_ast), CountOnly);
476    pablo_function_passes(&icgrepK);
477
478    ByteStream.setStreamSetBuffer(inputStream, fileSize);
479    BasisBits.allocateBuffer();
480
481    if (CountOnly) {
482        icgrepK.generateKernel({&BasisBits, &LineBreakStream}, {});
483        generatePipeline(iBuilder, {&mmapK, &s2pk, &linebreakK, &icgrepK});
484        iBuilder->CreateRet(icgrepK.createGetAccumulatorCall(icgrepK.getInstance(), "matchedLineCount"));
485    } else {
486#ifdef CUDA_ENABLED
487        if (codegen::NVPTX){
488            ExternalFileBuffer MatchResults(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(1, 1), addrSpace);
489            MatchResults.setStreamSetBuffer(outputStream, fileSize);
490
491            icgrepK.generateKernel({&BasisBits, &LineBreakStream},  {&MatchResults});
492            generatePipelineLoop(iBuilder, {&mmapK, &s2pk, &linebreakK, &icgrepK});
493
494        }
495#endif
496        if (CPU_Only) {
497            CircularBuffer MatchResults(iBuilder, iBuilder->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments);
498            MatchResults.allocateBuffer();
499
500            icgrepK.generateKernel({&BasisBits, &LineBreakStream}, {&MatchResults});
501
502            kernel::ScanMatchKernel scanMatchK(iBuilder, mGrepType);
503            scanMatchK.generateKernel({&MatchResults, &LineBreakStream}, {});               
504            scanMatchK.setInitialArguments({iBuilder->CreateBitCast(inputStream, int8PtrTy), fileSize, fileIdx});
505           
506            generatePipeline(iBuilder, {&mmapK, &s2pk, &linebreakK, &icgrepK, &scanMatchK});
507        }
508        iBuilder->CreateRetVoid();
509    }
510
511#ifdef CUDA_ENABLED
512    Function * mainCPUFn = nullptr;
513    if(codegen::NVPTX){
514        Function * kernelFunction = generateGPUKernel(M, iBuilder, CountOnly);
515        MDNode * Node = MDNode::get(M->getContext(),
516                                    {llvm::ValueAsMetadata::get(kernelFunction),
517                                     MDString::get(M->getContext(), "kernel"), 
518                                     ConstantAsMetadata::get(ConstantInt::get(iBuilder->getInt32Ty(), 1))});
519        NamedMDNode *NMD = M->getOrInsertNamedMetadata("nvvm.annotations");
520        NMD->addOperand(Node);
521   
522        Compile2PTX(M, IRFilename, PTXFilename);
523        mainCPUFn = generateCPUKernel(cpuM, CPUBuilder, mGrepType);
524        if (CountOnly) return;
525    }
526#endif
527
528
529    mEngine = JIT_to_ExecutionEngine(cpuM);
530    ApplyObjectCache(mEngine);
531    icgrep_Linking(cpuM, mEngine);
532
533#ifndef NDEBUG
534    verifyModule(*M, &dbgs());
535#endif
536
537    mEngine->finalizeObject();
538    delete iBuilder;
539   
540    if (CountOnly) {
541        mGrepFunction_CountOnly = reinterpret_cast<GrepFunctionType_CountOnly>(mEngine->getPointerToFunction(mainFn));
542    } else {
543#ifdef CUDA_ENABLED
544        if(codegen::NVPTX){
545            mGrepFunction_CPU = reinterpret_cast<GrepFunctionType_CPU>(mEngine->getPointerToFunction(mainCPUFn));
546        }
547#endif
548        if (CPU_Only) {
549            mGrepFunction = reinterpret_cast<GrepFunctionType>(mEngine->getPointerToFunction(mainFn));
550        }
551    }
552
553}
554
555re::CC * GrepEngine::grepCodepoints() {
556    parsedCodePointSet = re::makeCC();
557    char * mFileBuffer = getUnicodeNameDataPtr();
558    size_t mFileSize = getUnicodeNameDataSize();
559    mGrepFunction(mFileBuffer, mFileSize, 0);
560    return parsedCodePointSet;
561}
562
563const std::vector<std::string> & GrepEngine::grepPropertyValues(const std::string& propertyName) {
564    enum { MaxSupportedVectorWidthInBytes = 32 };
565    AlignedAllocator<char, MaxSupportedVectorWidthInBytes> alloc;
566    parsedPropertyValues.clear();
567    const std::string & str = UCD::getPropertyValueGrepString(propertyName);
568    const auto n = str.length();
569    // NOTE: MaxSupportedVectorWidthInBytes of trailing 0s are needed to prevent the grep function from
570    // erroneously matching garbage data when loading the final partial block.
571    char * aligned = alloc.allocate(n + MaxSupportedVectorWidthInBytes, 0);
572    std::memcpy(aligned, str.data(), n);
573    std::memset(aligned + n, 0, MaxSupportedVectorWidthInBytes);
574    mGrepFunction(aligned, n, 0);
575    alloc.deallocate(aligned, 0);
576    return parsedPropertyValues;
577}
578
579static int * total_count;
580static std::stringstream * resultStrs = nullptr;
581static std::vector<std::string> inputFiles;
582
583void initResult(std::vector<std::string> filenames){
584    const int n = filenames.size();
585    if (n > 1) {
586        ShowFileNames = true;
587    }
588    inputFiles = filenames;
589    resultStrs = new std::stringstream[n];
590    total_count = new int[n];
591    for (unsigned i = 0; i < inputFiles.size(); ++i){
592        total_count[i] = 0;
593    }
594   
595}
596
597extern "C" {
598    void wrapped_report_match(size_t lineNum, size_t line_start, size_t line_end, const char * buffer, size_t filesize, int fileIdx) {
599        assert (buffer);
600#ifdef CUDA_ENABLED
601    if (codegen::NVPTX){
602        while(line_start>startPoints[blockNo]) blockNo++;
603        line_start -= accumBytes[blockNo-1];
604        line_end -= accumBytes[blockNo-1];
605    }
606#endif
607        int index = isUTF_16 ? 2 : 1;
608        int idx = fileIdx;
609         
610        if (ShowFileNames) {
611            resultStrs[idx] << inputFiles[idx] << ':';
612        }
613        if (ShowLineNumbers) {
614            resultStrs[idx] << lineNum << ":";
615        }
616       
617        if ((!isUTF_16 && buffer[line_start] == 0xA) && (line_start != line_end)) {
618            // The line "starts" on the LF of a CRLF.  Really the end of the last line.
619            line_start++;
620        }
621        if (((isUTF_16 && buffer[line_start] == 0x0) && buffer[line_start + 1] == 0xA) && (line_start != line_end)) {
622            // The line "starts" on the LF of a CRLF.  Really the end of the last line.
623            line_start += 2;
624        }
625        if (line_end == filesize) {
626            // The match position is at end-of-file.   We have a final unterminated line.
627            resultStrs[idx].write(&buffer[line_start * index], (line_end - line_start) * index);
628            if (NormalizeLineBreaks) {
629                resultStrs[idx] << '\n';  // terminate it
630            }
631            return;
632        }
633        unsigned char end_byte = (unsigned char)buffer[line_end]; 
634        unsigned char penult_byte = (unsigned char)(buffer[line_end - 1]);
635        if (NormalizeLineBreaks) {
636            if (end_byte == 0x85) {
637                // Line terminated with NEL, on the second byte.  Back up 1.
638                line_end--;
639            } else if (end_byte > 0xD) {
640                // Line terminated with PS or LS, on the third byte.  Back up 2.
641                isUTF_16 ? line_end-- : line_end -= 2;
642            }
643            resultStrs[idx].write(&buffer[line_start * index], (line_end - line_start) * index);
644            resultStrs[idx] << '\n';
645        } else {
646            if ((!isUTF_16 && end_byte == 0x0D) || (isUTF_16 && (end_byte == 0x0D && penult_byte == 0x0))) {
647                // Check for line_end on first byte of CRLF;  note that we don't
648                // want to access past the end of buffer.
649                if (line_end + 1 < filesize) {
650                    if (!isUTF_16 && buffer[line_end + 1] == 0x0A) {
651                        // Found CRLF; preserve both bytes.
652                        line_end++;
653                    }
654                    if (isUTF_16 && buffer[line_end + 1] == 0x0 && buffer[line_end + 2] == 0x0A) {
655                        // Found CRLF; preserve both bytes.
656                        line_end += 2;
657                    }
658                }
659            }
660            resultStrs[idx].write(&buffer[line_start * index], (line_end - line_start + 1) * index);
661        }
662    }
663}
664
665void PrintResult(bool CountOnly, std::vector<size_t> & total_CountOnly){
666   
667    if(CountOnly){
668        if (!ShowFileNames) {
669            for (unsigned i = 0; i < inputFiles.size(); ++i){
670                std::cout << total_CountOnly[i] << std::endl;
671            }
672        }
673        else {
674            for (unsigned i = 0; i < inputFiles.size(); ++i){
675                std::cout << inputFiles[i] << ':' << total_CountOnly[i] << std::endl;
676            };
677        }
678        return;
679    }
680   
681    for (unsigned i = 0; i < inputFiles.size(); ++i){
682        std::cout << resultStrs[i].str();
683    }
684}
685
686extern "C" {
687    void insert_codepoints(size_t lineNum, size_t line_start, size_t line_end, const char * buffer) {
688        assert (buffer);
689        re::codepoint_t c = 0;
690        ssize_t line_pos = line_start;
691        while (isxdigit(buffer[line_pos])) {
692            if (isdigit(buffer[line_pos])) {
693                c = (c << 4) | (buffer[line_pos] - '0');
694            }
695            else {
696                c = (c << 4) | (tolower(buffer[line_pos]) - 'a' + 10);
697            }
698            line_pos++;
699        }
700        assert(((line_pos - line_start) >= 4) && ((line_pos - line_start) <= 6)); // UCD format 4 to 6 hex digits.       
701        parsedCodePointSet->insert(c);
702    }
703}
704
705extern "C" {
706    void insert_property_values(size_t lineNum, size_t line_start, size_t line_end, const char * buffer) {
707        parsedPropertyValues.emplace_back(buffer + line_start, buffer + line_end);
708    }
709}
710
711void icgrep_Linking(Module * m, ExecutionEngine * e) {
712    Module::FunctionListType & fns = m->getFunctionList();
713    for (auto it = fns.begin(), it_end = fns.end(); it != it_end; ++it) {
714        std::string fnName = it->getName().str();
715        if (fnName == "s2p_block") continue;
716        if (fnName == "process_block") continue;
717        if (fnName == "process_block_initialize_carries") continue;
718       
719        if (fnName == "wrapped_report_match") {
720            e->addGlobalMapping(cast<GlobalValue>(it), (void *)&wrapped_report_match);
721        }
722        if (fnName == "insert_codepoints") {
723            e->addGlobalMapping(cast<GlobalValue>(it), (void *)&insert_codepoints);
724        }
725        if (fnName == "insert_property_values") {
726            e->addGlobalMapping(cast<GlobalValue>(it), (void *)&insert_property_values);
727        }
728    }
729}
730
731GrepEngine::GrepEngine()
732: mGrepFunction(nullptr)
733, mGrepFunction_CountOnly(nullptr)
734, mGrepFunction_CPU(nullptr)
735, mGrepType(GrepType::Normal)
736, mEngine(nullptr) {
737
738}
739
740GrepEngine::~GrepEngine() {
741    delete mEngine;
742}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.