source: icGREP/icgrep-devel/icgrep/grep_engine.cpp @ 5548

Last change on this file since 5548 was 5548, checked in by cameron, 2 years ago

Decouple finalizeMatchResults, creating separate MatchedLinesKernel?

File size: 29.7 KB
Line 
1/*
2 *  Copyright (c) 2017 International Characters.
3 *  This software is licensed to the public under the Open Software License 3.0.
4 *  icgrep is a trademark of International Characters.
5 */
6
7#include "grep_engine.h"
8#include "grep_interface.h"
9#include <llvm/IR/Module.h>
10#include <boost/filesystem.hpp>
11#include <UCD/UnicodeNameData.h>
12#include <UCD/resolve_properties.h>
13#include <kernels/cc_kernel.h>
14#include <kernels/grep_kernel.h>
15#include <kernels/linebreak_kernel.h>
16#include <kernels/streams_merge.h>
17#include <kernels/source_kernel.h>
18#include <kernels/s2p_kernel.h>
19#include <kernels/scanmatchgen.h>
20#include <kernels/streamset.h>
21#include <kernels/until_n.h>
22#include <kernels/kernel_builder.h>
23#include <pablo/pablo_kernel.h>
24#include <re/re_cc.h>
25#include <re/re_toolchain.h>
26#include <toolchain/toolchain.h>
27#include <toolchain/cpudriver.h>
28#include <toolchain/NVPTXDriver.h>
29#include <iostream>
30#include <sstream>
31#include <cc/multiplex_CCs.h>
32#include <llvm/Support/raw_ostream.h>
33#include <util/aligned_allocator.h>
34#include <sys/stat.h>
35#include <fcntl.h>
36#include <errno.h>
37#include <mutex>
38#ifdef CUDA_ENABLED
39#include <preprocess.cpp>
40#include <IR_Gen/CudaDriver.h>
41#endif
42
43using namespace parabix;
44using namespace llvm;
45
46namespace grep {
47
48static std::stringstream * resultStrs = nullptr;
49static std::vector<std::string> inputFiles;
50static std::vector<std::string> linePrefix;
51static bool grepMatchFound;
52
53size_t * startPoints = nullptr;
54size_t * accumBytes = nullptr;
55
56
57std::mutex count_mutex;
58size_t fileCount;
59
60// DoGrep thread function.
61void *DoGrepThreadFunction(void *args)
62{
63    size_t fileIdx;
64    grep::GrepEngine * grepEngine = (grep::GrepEngine *)args;
65
66    count_mutex.lock();
67    fileIdx = fileCount;
68    fileCount++;
69    count_mutex.unlock();
70
71    while (fileIdx < inputFiles.size()) {
72        size_t grepResult = grepEngine->doGrep(inputFiles[fileIdx], fileIdx);
73       
74        count_mutex.lock();
75        if (grepResult > 0) grepMatchFound = true;
76        fileIdx = fileCount;
77        fileCount++;
78        count_mutex.unlock();
79        if (QuietMode && grepMatchFound) pthread_exit(nullptr);
80    }
81
82    pthread_exit(nullptr);
83}
84
85bool GrepEngine::matchesNeedToBeMovedToEOL() const {
86    if ((Mode == QuietMode) | (Mode == FilesWithMatch) | (Mode == FilesWithoutMatch)) {
87        return false;
88    }
89    else if (LineRegexpFlag) {
90        return false;
91    }
92    // TODO: return false for other cases based on regexp analysis, e.g., regexp ends with $.
93    return true;
94}
95   
96void GrepEngine::doGrep(const std::string & fileName) const{
97#ifdef CUDA_ENABLED
98    const bool CountOnly = true;
99    boost::filesystem::path file(fileName);
100    if (exists(file)) {
101        if (is_directory(file)) {
102            return;
103        }
104    } else {
105        if (!NoMessagesFlag) {
106            std::cerr << "Error: cannot open " << fileName << " for processing. Skipped.\n";
107            return;
108        }
109    }
110
111    const auto fileSize = file_size(file);
112   
113    if (fileSize > 0) {
114        try {
115            boost::iostreams::mapped_file_source source(fileName, fileSize, 0);
116            char * fileBuffer = const_cast<char *>(source.data());
117           
118            codegen::BlockSize = 128;
119            std::vector<size_t> LFPositions = preprocess(fileBuffer, fileSize);
120           
121            const unsigned numOfGroups = codegen::GroupNum;
122            if (posix_memalign((void**)&startPoints, 8, (numOfGroups+1)*sizeof(size_t)) ||
123                posix_memalign((void**)&accumBytes, 8, (numOfGroups+1)*sizeof(size_t))) {
124                std::cerr << "Cannot allocate memory for startPoints or accumBytes.\n";
125                exit(-1);
126            }
127            const auto PTXFilename = mGrepDriver->getBuilder()->getModule()->getModuleIdentifier() + ".ptx";
128            RunPTX(PTXFilename, fileBuffer, fileSize, CountOnly, LFPositions, startPoints, accumBytes);
129            source.close();
130        } catch (std::exception & e) {
131            if (!NoMessagesFlag) {
132                std::cerr << "Boost mmap error: " + fileName + ": " + e.what() + " Skipped.\n";
133                return;
134            }
135        }
136    } else {
137        std::cout << 0 << std::endl;
138    }
139#endif
140}
141
142uint64_t GrepEngine::doGrep(const std::string & fileName, const uint32_t fileIdx) const {
143    struct stat sb;
144    const int32_t fd = open(fileName.c_str(), O_RDONLY);
145    if (LLVM_UNLIKELY(fd == -1)) {
146        if (!NoMessagesFlag  && !(Mode == QuietMode)) {
147            if (errno == EACCES) {
148                resultStrs[fileIdx] << "icgrep: " << fileName << ": Permission denied.\n";
149            }
150            else if (errno == ENOENT) {
151                resultStrs[fileIdx] << "icgrep: " << fileName << ": No such file.\n";
152            }
153            else {
154                resultStrs[fileIdx] << "icgrep: " << fileName << ": Failed.\n";
155            }
156        }
157        return 0;
158    }
159    if (stat(fileName.c_str(), &sb) == 0 && S_ISDIR(sb.st_mode)) {
160        if (!NoMessagesFlag  && !(Mode == QuietMode)) {
161            resultStrs[fileIdx] << "icgrep: " << fileName << ": Is a directory.\n";
162        }
163        close(fd);
164        return 0;
165    }
166    const auto result = doGrep(fd, fileIdx);
167    close(fd);
168    return result;
169}
170
171uint64_t GrepEngine::doGrep(const int32_t fileDescriptor, const uint32_t fileIdx) const {
172    assert (mGrepDriver);
173    typedef uint64_t (*GrepFunctionType)(int32_t fileDescriptor, const uint32_t fileIdx);
174    auto f = reinterpret_cast<GrepFunctionType>(mGrepDriver->getMain());
175   
176    uint64_t grepResult = f(fileDescriptor, fileIdx);
177    if (grepResult > 0) grepMatchFound = true;
178    else if ((Mode == NormalMode) && !resultStrs[fileIdx].str().empty()) grepMatchFound = true;
179   
180    if (Mode == CountOnly) {
181        resultStrs[fileIdx] << linePrefix[fileIdx] << grepResult << "\n";
182    }
183    else if (Mode == FilesWithMatch || Mode == FilesWithoutMatch ) {
184        size_t requiredCount = Mode == FilesWithMatch ? 1 : 0;
185        if (grepResult == requiredCount) {
186            resultStrs[fileIdx] << linePrefix[fileIdx];
187        }
188    }
189    else if (Mode == QuietMode) {
190        if (grepMatchFound) exit(MatchFoundExitCode);
191    }
192    return grepResult;
193}
194
195void initFileResult(std::vector<std::string> filenames){
196    grepMatchFound = false;
197    const int n = filenames.size();
198    linePrefix.resize(n);
199    if ((n > 1) && !NoFilenameFlag) {
200        WithFilenameFlag = true;
201    }
202    std::string fileSuffix = "";
203    bool setLinePrefix = WithFilenameFlag || (Mode == FilesWithMatch) || (Mode == FilesWithoutMatch);
204    if (setLinePrefix) {
205        if (NullFlag) {
206            fileSuffix = std::string("\0", 1);
207        }
208        else if ((Mode == NormalMode) && InitialTabFlag && !(LineNumberFlag || ByteOffsetFlag)) {
209            fileSuffix = "\t:";
210        }
211        else if ((Mode == NormalMode) || (Mode == CountOnly)) {
212            fileSuffix = ":";
213        }
214        else if ((Mode == FilesWithMatch) || (Mode == FilesWithoutMatch)) {
215            fileSuffix = "\n";
216        }
217    }
218    inputFiles = filenames;
219    resultStrs = new std::stringstream[n];
220    for (unsigned i = 0; i < inputFiles.size(); ++i) {
221        if (setLinePrefix) {
222            if (inputFiles[i] == "-") {
223                linePrefix[i] = LabelFlag + fileSuffix;
224            }
225            else {
226                linePrefix[i] = inputFiles[i] + fileSuffix;
227            }
228        }
229    }
230}
231
232template<typename CodeUnit>
233void wrapped_report_match(const size_t lineNum, size_t line_start, size_t line_end, const CodeUnit * const buffer, const size_t filesize, const size_t fileIdx) {
234
235//    errs().write_hex((size_t)buffer) << " : " << lineNum << " (" << line_start << ", " << line_end << ", " << filesize << ")\n";
236
237    assert (buffer);
238    assert (line_start <= line_end);
239    assert (line_end <= filesize);
240
241    if (WithFilenameFlag) {
242        resultStrs[fileIdx] << linePrefix[fileIdx];
243    }
244    if (LineNumberFlag) {
245        // Internally line numbers are counted from 0.  For display, adjust
246        // the line number so that lines are numbered from 1.
247        if (InitialTabFlag) {
248            resultStrs[fileIdx] << lineNum+1 << "\t:";
249        }
250        else {
251            resultStrs[fileIdx] << lineNum+1 << ":";
252        }
253    }
254
255    // If the line "starts" on the LF of a CRLF, it is actually the end of the last line.
256    if ((buffer[line_start] == 0xA) && (line_start != line_end)) {
257        ++line_start;
258    }
259
260    if (LLVM_UNLIKELY(line_end == filesize)) {
261        // The match position is at end-of-file.   We have a final unterminated line.
262        resultStrs[fileIdx].write((char *)&buffer[line_start], (line_end - line_start) * sizeof(CodeUnit));
263        if (NormalizeLineBreaksFlag) {
264            resultStrs[fileIdx] << '\n';  // terminate it
265        }
266    } else {
267        const auto end_byte = buffer[line_end];
268        if (grep::NormalizeLineBreaksFlag) {
269            if (LLVM_UNLIKELY(end_byte == 0x85)) {
270                // Line terminated with NEL, on the second byte.  Back up 1.
271                line_end -= 1;
272            } else if (LLVM_UNLIKELY(end_byte > 0xD)) {
273                // Line terminated with PS or LS, on the third byte.  Back up 2.
274                line_end -= 2;
275            }
276            resultStrs[fileIdx].write((char *)&buffer[line_start], (line_end - line_start) * sizeof(CodeUnit));
277            resultStrs[fileIdx] << '\n';
278        } else {
279            if (end_byte == 0x0D) {
280                // Check for line_end on first byte of CRLF; we don't want to access past the end of buffer.
281                if ((line_end + 1) < filesize) {
282                    if (buffer[line_end + 1] == 0x0A) {
283                        // Found CRLF; preserve both bytes.
284                        ++line_end;
285                    }
286                }
287            }
288            resultStrs[fileIdx].write((char *)&buffer[line_start], (line_end - line_start + 1) * sizeof(CodeUnit));
289        }
290    }
291}
292
293void PrintResults(){
294   
295    for (unsigned i = 0; i < inputFiles.size(); ++i){
296        std::cout << resultStrs[i].str();
297    }
298    exit(grepMatchFound ? MatchFoundExitCode : MatchNotFoundExitCode);
299}
300
301void GrepEngine::grepCodeGen_nvptx(std::vector<re::RE *> REs, const GrepModeType grepMode, const bool UTF_16) {
302
303    assert (mGrepDriver == nullptr);
304
305    mGrepDriver = new NVPTXDriver("engine");
306    auto & idb = mGrepDriver->getBuilder();
307    Module * M = idb->getModule();
308
309    const unsigned segmentSize = codegen::SegmentSize;
310    const unsigned bufferSegments = codegen::BufferSegments * codegen::ThreadNum;
311    const unsigned encodingBits = UTF_16 ? 16 : 8;
312
313    Type * const int64Ty = idb->getInt64Ty();
314    Type * const int32Ty = idb->getInt32Ty();
315    Type * const size_ty = idb->getSizeTy();
316    Type * const sizeTyPtr = PointerType::get(size_ty, 1);
317    Type * const int64tyPtr = PointerType::get(int64Ty, 1);
318    Type * const voidTy = idb->getVoidTy();
319   
320    size_t MatchLimit = ((grepMode == QuietMode) | (grepMode == FilesWithMatch) | (grepMode == FilesWithoutMatch)) ? 1 : MaxCountFlag;
321
322    Function * mainFunc = cast<Function>(M->getOrInsertFunction("Main", voidTy, int64tyPtr, sizeTyPtr, sizeTyPtr, int64tyPtr, nullptr));
323    mainFunc->setCallingConv(CallingConv::C);
324    idb->SetInsertPoint(BasicBlock::Create(M->getContext(), "entry", mainFunc, 0));
325    auto args = mainFunc->arg_begin();
326
327    Value * const inputPtr = &*(args++);
328    inputPtr->setName("inputPtr");
329    Value * const startPointsPtr = &*(args++);
330    startPointsPtr->setName("startPointsPtr");
331    Value * const bufferSizesPtr = &*(args++);
332    bufferSizesPtr->setName("bufferSizesPtr");
333    Value * const outputPtr = &*(args++);
334    outputPtr->setName("outputPtr");
335
336    Function * tidFunc = M->getFunction("llvm.nvvm.read.ptx.sreg.tid.x");
337    Value * tid = idb->CreateCall(tidFunc);
338    Function * bidFunc = cast<Function>(M->getOrInsertFunction("llvm.nvvm.read.ptx.sreg.ctaid.x", int32Ty, nullptr));
339    Value * bid = idb->CreateCall(bidFunc);
340
341    Value * startPoint = idb->CreateLoad(idb->CreateGEP(startPointsPtr, bid));
342    Value * startBlock = idb->CreateUDiv(startPoint, ConstantInt::get(int64Ty, idb->getBitBlockWidth()));
343    Type * const inputStreamType = PointerType::get(ArrayType::get(ArrayType::get(idb->getBitBlockType(), 8), 1), 1);   
344    Value * inputStreamPtr = idb->CreateGEP(idb->CreateBitCast(inputPtr, inputStreamType), startBlock);
345    Value * inputStream = idb->CreateGEP(inputStreamPtr, tid);
346    Value * bufferSize = idb->CreateLoad(idb->CreateGEP(bufferSizesPtr, bid));
347
348    StreamSetBuffer * ByteStream = mGrepDriver->addBuffer(make_unique<SourceBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 8), 1));
349    kernel::Kernel * sourceK = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::MemorySourceKernel>(idb, inputStreamType, segmentSize));
350    sourceK->setInitialArguments({inputStream, bufferSize});
351    mGrepDriver->makeKernelCall(sourceK, {}, {ByteStream});
352
353    StreamSetBuffer * BasisBits = mGrepDriver->addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(8, 1), segmentSize * bufferSegments));
354    kernel::Kernel * s2pk = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::S2PKernel>(idb));
355    mGrepDriver->makeKernelCall(s2pk, {ByteStream}, {BasisBits});
356 
357    StreamSetBuffer * LineBreakStream = mGrepDriver->addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments));
358    kernel::Kernel * linebreakK = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::LineBreakKernelBuilder>(idb, encodingBits));
359    mGrepDriver->makeKernelCall(linebreakK, {BasisBits}, {LineBreakStream});
360   
361    const auto n = REs.size();
362
363    std::vector<StreamSetBuffer *> MatchResultsBufs(n);
364
365    for(unsigned i = 0; i < n; ++i){
366        StreamSetBuffer * MatchResults = mGrepDriver->addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments));
367        kernel::Kernel * icgrepK = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::ICGrepKernel>(idb, REs[i]));
368        mGrepDriver->makeKernelCall(icgrepK, {BasisBits, LineBreakStream}, {MatchResults});
369        MatchResultsBufs[i] = MatchResults;
370    }
371    StreamSetBuffer * MergedResults = MatchResultsBufs[0];
372    if (REs.size() > 1) {
373        MergedResults = mGrepDriver->addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments));
374        kernel::Kernel * streamsMergeK = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::StreamsMerge>(idb, 1, REs.size()));
375        mGrepDriver->makeKernelCall(streamsMergeK, MatchResultsBufs, {MergedResults});
376    }
377    StreamSetBuffer * Matches = MergedResults;
378
379    if (matchesNeedToBeMovedToEOL()) {
380        StreamSetBuffer * OriginalMatches = Matches;
381        kernel::Kernel * matchedLinesK = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::MatchedLinesKernel>(idb));
382        Matches = mGrepDriver->addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments));
383        mGrepDriver->makeKernelCall(matchedLinesK, {OriginalMatches, LineBreakStream}, {Matches});
384    }
385   
386    if (InvertMatchFlag) {
387        kernel::Kernel * invertK = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::InvertMatchesKernel>(idb));
388        StreamSetBuffer * OriginalMatches = Matches;
389        Matches = mGrepDriver->addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments));
390        mGrepDriver->makeKernelCall(invertK, {OriginalMatches, LineBreakStream}, {Matches});
391    }
392    if (MatchLimit > 0) {
393        kernel::Kernel * untilK = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::UntilNkernel>(idb));
394        untilK->setInitialArguments({idb->getSize(MatchLimit)});
395        StreamSetBuffer * AllMatches = Matches;
396        Matches = mGrepDriver->addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments));
397        mGrepDriver->makeKernelCall(untilK, {AllMatches}, {Matches});
398    }
399   
400    kernel::Kernel * matchCountK = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::PopcountKernel>(idb));
401    mGrepDriver->makeKernelCall(matchCountK, {Matches}, {});
402    mGrepDriver->generatePipelineIR();
403    idb->setKernel(matchCountK);
404    Value * matchedLineCount = idb->getAccumulator("countResult");
405    matchedLineCount = idb->CreateZExt(matchedLineCount, int64Ty);
406   
407    Value * strideBlocks = ConstantInt::get(int32Ty, idb->getStride() / idb->getBitBlockWidth());
408    Value * outputThreadPtr = idb->CreateGEP(outputPtr, idb->CreateAdd(idb->CreateMul(bid, strideBlocks), tid));
409    idb->CreateStore(matchedLineCount, outputThreadPtr);
410    idb->CreateRetVoid();
411
412    mGrepDriver->finalizeObject();
413}
414
415void GrepEngine::grepCodeGen(std::vector<re::RE *> REs, const GrepModeType grepMode, const bool UTF_16, GrepSource grepSource) {
416
417    assert (mGrepDriver == nullptr);
418    mGrepDriver = new ParabixDriver("engine");
419    auto & idb = mGrepDriver->getBuilder();
420    Module * M = idb->getModule();
421
422    const unsigned segmentSize = codegen::SegmentSize;
423    const unsigned bufferSegments = codegen::BufferSegments * codegen::ThreadNum;
424    const unsigned encodingBits = UTF_16 ? 16 : 8;
425
426    Type * const int64Ty = idb->getInt64Ty();
427    Type * const int32Ty = idb->getInt32Ty();
428
429    kernel::Kernel * sourceK = nullptr;
430   
431    size_t MatchLimit = ((grepMode == QuietMode) | (grepMode == FilesWithMatch) | (grepMode == FilesWithoutMatch)) ? 1 : MaxCountFlag;
432
433    Function * mainFunc = cast<Function>(M->getOrInsertFunction("Main", int64Ty, idb->getInt32Ty(), int32Ty, nullptr));
434    mainFunc->setCallingConv(CallingConv::C);
435    idb->SetInsertPoint(BasicBlock::Create(M->getContext(), "entry", mainFunc, 0));
436    auto args = mainFunc->arg_begin();
437
438    Value * const fileDescriptor = &*(args++);
439    fileDescriptor->setName("fileDescriptor");
440    Value * fileIdx = &*(args++);
441    fileIdx->setName("fileIdx");
442
443    StreamSetBuffer * ByteStream = mGrepDriver->addBuffer(make_unique<SourceBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 8)));
444
445    if (grepSource == GrepSource::File) {
446        sourceK = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::MMapSourceKernel>(idb, segmentSize));
447    } else {
448        sourceK = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::ReadSourceKernel>(idb, segmentSize));
449    }
450    sourceK->setInitialArguments({fileDescriptor});
451
452    mGrepDriver->makeKernelCall(sourceK, {}, {ByteStream});
453    StreamSetBuffer * BasisBits = mGrepDriver->addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(8, 1), segmentSize * bufferSegments));
454   
455    kernel::Kernel * s2pk = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::S2PKernel>(idb));
456    mGrepDriver->makeKernelCall(s2pk, {ByteStream}, {BasisBits});
457   
458    kernel::Kernel * linebreakK = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::LineBreakKernelBuilder>(idb, encodingBits));
459    StreamSetBuffer * LineBreakStream = mGrepDriver->addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments));
460    mGrepDriver->makeKernelCall(linebreakK, {BasisBits}, {LineBreakStream});
461   
462    const auto n = REs.size();
463
464    std::vector<StreamSetBuffer *> MatchResultsBufs(n);
465
466    for(unsigned i = 0; i < n; ++i){
467        StreamSetBuffer * MatchResults = mGrepDriver->addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments));
468        kernel::Kernel * icgrepK = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::ICGrepKernel>(idb, REs[i]));
469        mGrepDriver->makeKernelCall(icgrepK, {BasisBits, LineBreakStream}, {MatchResults});
470        MatchResultsBufs[i] = MatchResults;
471    }
472    StreamSetBuffer * MergedResults = MatchResultsBufs[0];
473    if (REs.size() > 1) {
474        MergedResults = mGrepDriver->addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments));
475        kernel::Kernel * streamsMergeK = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::StreamsMerge>(idb, 1, REs.size()));
476        mGrepDriver->makeKernelCall(streamsMergeK, MatchResultsBufs, {MergedResults});
477    }
478    StreamSetBuffer * Matches = MergedResults;
479   
480    if (matchesNeedToBeMovedToEOL()) {
481        StreamSetBuffer * OriginalMatches = Matches;
482        kernel::Kernel * matchedLinesK = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::MatchedLinesKernel>(idb));
483        Matches = mGrepDriver->addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments));
484        mGrepDriver->makeKernelCall(matchedLinesK, {OriginalMatches, LineBreakStream}, {Matches});
485    }
486   
487    if (InvertMatchFlag) {
488        kernel::Kernel * invertK = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::InvertMatchesKernel>(idb));
489        StreamSetBuffer * OriginalMatches = Matches;
490        Matches = mGrepDriver->addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments));
491        mGrepDriver->makeKernelCall(invertK, {OriginalMatches, LineBreakStream}, {Matches});
492    }
493    if (MatchLimit > 0) {
494        kernel::Kernel * untilK = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::UntilNkernel>(idb));
495        untilK->setInitialArguments({idb->getSize(MatchLimit)});
496        StreamSetBuffer * AllMatches = Matches;
497        Matches = mGrepDriver->addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize * bufferSegments));
498        mGrepDriver->makeKernelCall(untilK, {AllMatches}, {Matches});
499    }
500    if (grepMode == NormalMode) {
501        kernel::Kernel * scanMatchK = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::ScanMatchKernel>(idb, GrepType::Normal, encodingBits));
502        scanMatchK->setInitialArguments({fileIdx});
503        mGrepDriver->makeKernelCall(scanMatchK, {Matches, LineBreakStream, ByteStream}, {});
504        if (UTF_16) {
505            mGrepDriver->LinkFunction(*scanMatchK, "matcher", &wrapped_report_match<uint16_t>);
506        } else {
507            mGrepDriver->LinkFunction(*scanMatchK, "matcher", &wrapped_report_match<uint8_t>);
508        }
509        mGrepDriver->generatePipelineIR();
510        mGrepDriver->deallocateBuffers();
511
512        idb->CreateRet(idb->getInt64(0));
513    } else {
514        kernel::Kernel * matchCountK = mGrepDriver->addKernelInstance(make_unique<kernel::PopcountKernel>(idb));
515        mGrepDriver->makeKernelCall(matchCountK, {Matches}, {});
516        mGrepDriver->generatePipelineIR();
517        idb->setKernel(matchCountK);
518        Value * matchedLineCount = idb->getAccumulator("countResult");
519        matchedLineCount = idb->CreateZExt(matchedLineCount, int64Ty);
520        mGrepDriver->deallocateBuffers();
521        idb->CreateRet(matchedLineCount);
522    }
523    mGrepDriver->finalizeObject();
524}
525
526GrepEngine::GrepEngine()
527: mGrepDriver(nullptr) {
528
529}
530
531GrepEngine::~GrepEngine() {
532    delete mGrepDriver;
533}
534
535
536   
537static re::CC * parsedCodePointSet = nullptr;
538
539void insert_codepoints(const size_t lineNum, const size_t line_start, const size_t line_end, const char * const buffer) {
540    assert (buffer);
541    assert (line_start <= line_end);
542    re::codepoint_t c = 0;
543    size_t line_pos = line_start;
544    while (isxdigit(buffer[line_pos])) {
545        assert (line_pos < line_end);
546        if (isdigit(buffer[line_pos])) {
547            c = (c << 4) | (buffer[line_pos] - '0');
548        }
549        else {
550            c = (c << 4) | (tolower(buffer[line_pos]) - 'a' + 10);
551        }
552        line_pos++;
553    }
554    assert(((line_pos - line_start) >= 4) && ((line_pos - line_start) <= 6)); // UCD format 4 to 6 hex digits.
555    parsedCodePointSet->insert(c);
556}
557
558re::CC * grepCodepoints(re::RE * pattern, char * UnicodeDataBuffer, size_t bufferLength) {
559    parsedCodePointSet = re::makeCC();       
560    const unsigned segmentSize = 8;
561
562    ParabixDriver pxDriver("codepointEngine");
563    auto & idb = pxDriver.getBuilder();
564    Module * M = idb->getModule();
565   
566    Function * mainFunc = cast<Function>(M->getOrInsertFunction("Main", idb->getVoidTy(), idb->getInt8PtrTy(), idb->getSizeTy(), nullptr));
567    mainFunc->setCallingConv(CallingConv::C);
568    auto args = mainFunc->arg_begin();
569    Value * const buffer = &*(args++);
570    buffer->setName("buffer");
571    Value * length = &*(args++);
572    length->setName("length");
573   
574    idb->SetInsertPoint(BasicBlock::Create(M->getContext(), "entry", mainFunc, 0));
575   
576    StreamSetBuffer * ByteStream = pxDriver.addBuffer(make_unique<SourceBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 8)));
577    kernel::Kernel * sourceK = pxDriver.addKernelInstance(make_unique<kernel::MemorySourceKernel>(idb, idb->getInt8PtrTy(), segmentSize));
578    sourceK->setInitialArguments({buffer, length});
579    pxDriver.makeKernelCall(sourceK, {}, {ByteStream});
580   
581    StreamSetBuffer * BasisBits = pxDriver.addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(8, 1), segmentSize));
582   
583    kernel::Kernel * s2pk = pxDriver.addKernelInstance(make_unique<kernel::S2PKernel>(idb));
584    pxDriver.makeKernelCall(s2pk, {ByteStream}, {BasisBits});
585   
586    kernel::Kernel * linebreakK = pxDriver.addKernelInstance(make_unique<kernel::LineBreakKernelBuilder>(idb, 8));
587    StreamSetBuffer * LineBreakStream = pxDriver.addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize));
588    pxDriver.makeKernelCall(linebreakK, {BasisBits}, {LineBreakStream});
589   
590    StreamSetBuffer * MatchResults = pxDriver.addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize));
591    kernel::Kernel * icgrepK = pxDriver.addKernelInstance(make_unique<kernel::ICGrepKernel>(idb, pattern));
592    pxDriver.makeKernelCall(icgrepK, {BasisBits, LineBreakStream}, {MatchResults});
593   
594    StreamSetBuffer * MatchedLines = pxDriver.addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize));
595    kernel::Kernel * matchedLinesK = pxDriver.addKernelInstance(make_unique<kernel::MatchedLinesKernel>(idb));
596    pxDriver.makeKernelCall(matchedLinesK, {MatchResults, LineBreakStream}, {MatchedLines});
597   
598    kernel::Kernel * scanMatchK = pxDriver.addKernelInstance(make_unique<kernel::ScanMatchKernel>(idb, GrepType::NameExpression, 8));
599    scanMatchK->setInitialArguments({idb->getInt32(0)});
600    pxDriver.makeKernelCall(scanMatchK, {MatchedLines, LineBreakStream, ByteStream}, {});
601    pxDriver.LinkFunction(*scanMatchK, "matcher", &insert_codepoints);
602    pxDriver.generatePipelineIR();
603    idb->CreateRetVoid();
604    pxDriver.finalizeObject();
605   
606    typedef void (*GrepFunctionType)(const char * buffer, const size_t length);
607    auto f = reinterpret_cast<GrepFunctionType>(pxDriver.getMain());
608    f(UnicodeDataBuffer, bufferLength);
609   
610    return parsedCodePointSet;   
611}
612
613   
614static std::vector<std::string> parsedPropertyValues;
615
616void insert_property_values(size_t lineNum, size_t line_start, size_t line_end, const char * buffer) {
617    assert (line_start <= line_end);
618    parsedPropertyValues.emplace_back(buffer + line_start, buffer + line_end);
619}
620
621
622const std::vector<std::string> & grepPropertyValues(const std::string& propertyName, re::RE * propertyValuePattern) {
623    ParabixDriver pxDriver("propertyValueEngine");
624    AlignedAllocator<char, 32> alloc;
625
626    parsedPropertyValues.clear();
627
628    const std::string & str = UCD::getPropertyValueGrepString(propertyName);
629
630    auto & idb = pxDriver.getBuilder();
631
632    const unsigned segmentSize = 8;
633    const auto n = str.length();
634    const auto w = idb->getBitBlockWidth() * segmentSize;
635    const auto m = w - (n % w);
636
637    char * aligned = alloc.allocate(n + m, 0);
638    std::memcpy(aligned, str.data(), n);
639    std::memset(aligned + n, 0, m);
640
641    Module * M = idb->getModule();
642   
643    Function * mainFunc = cast<Function>(M->getOrInsertFunction("Main", idb->getVoidTy(), idb->getInt8PtrTy(), idb->getSizeTy(), nullptr));
644    mainFunc->setCallingConv(CallingConv::C);
645    auto args = mainFunc->arg_begin();
646    Value * const buffer = &*(args++);
647    buffer->setName("buffer");
648    Value * length = &*(args++);
649    length->setName("length");
650   
651    idb->SetInsertPoint(BasicBlock::Create(M->getContext(), "entry", mainFunc, 0));
652   
653    StreamSetBuffer * ByteStream = pxDriver.addBuffer(make_unique<SourceBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 8)));
654    kernel::Kernel * sourceK = pxDriver.addKernelInstance(make_unique<kernel::MemorySourceKernel>(idb, idb->getInt8PtrTy(), segmentSize));
655    sourceK->setInitialArguments({buffer, length});
656    pxDriver.makeKernelCall(sourceK, {}, {ByteStream});
657   
658    StreamSetBuffer * BasisBits = pxDriver.addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(8, 1), segmentSize));
659   
660    kernel::Kernel * s2pk = pxDriver.addKernelInstance(make_unique<kernel::S2PKernel>(idb));
661    pxDriver.makeKernelCall(s2pk, {ByteStream}, {BasisBits});
662   
663    kernel::Kernel * linebreakK = pxDriver.addKernelInstance(make_unique<kernel::LineBreakKernelBuilder>(idb, 8));
664    StreamSetBuffer * LineBreakStream = pxDriver.addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize));
665    pxDriver.makeKernelCall(linebreakK, {BasisBits}, {LineBreakStream});
666   
667    StreamSetBuffer * MatchResults = pxDriver.addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize));
668    kernel::Kernel * icgrepK = pxDriver.addKernelInstance(make_unique<kernel::ICGrepKernel>(idb, propertyValuePattern));
669    pxDriver.makeKernelCall(icgrepK, {BasisBits, LineBreakStream}, {MatchResults});
670
671    StreamSetBuffer * MatchedLines = pxDriver.addBuffer(make_unique<CircularBuffer>(idb, idb->getStreamSetTy(1, 1), segmentSize));
672    kernel::Kernel * matchedLinesK = pxDriver.addKernelInstance(make_unique<kernel::MatchedLinesKernel>(idb));
673    pxDriver.makeKernelCall(matchedLinesK, {MatchResults, LineBreakStream}, {MatchedLines});
674
675    kernel::Kernel * scanMatchK = pxDriver.addKernelInstance(make_unique<kernel::ScanMatchKernel>(idb, GrepType::PropertyValue, 8));
676    scanMatchK->setInitialArguments({idb->getInt32(0)});
677    pxDriver.makeKernelCall(scanMatchK, {MatchedLines, LineBreakStream, ByteStream}, {});
678    pxDriver.LinkFunction(*scanMatchK, "matcher", &insert_property_values);
679    pxDriver.generatePipelineIR();
680    idb->CreateRetVoid();
681    pxDriver.finalizeObject();
682
683    typedef void (*GrepFunctionType)(const char * buffer, const size_t length);
684    auto f = reinterpret_cast<GrepFunctionType>(pxDriver.getMain());
685    f(aligned, n);
686   
687    alloc.deallocate(aligned, 0);
688    return parsedPropertyValues;
689}
690
691   
692}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.